RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019577.9

Gipc1-201, Transcript of PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gipc1, Length 1,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa49,23■■■■■ 5,47
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Kdm5dQ62240 1548 aa43,52■■■■■ 4,56
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42,82■■■■■ 4,45
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rtl1Q7M732 1744 aa41,53■■■■■ 4,24
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Fam135aQ6NS59 1506 aa39,03■■■■□ 3,84
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Unc13aQ4KUS2 1712 aa38,95■■■■□ 3,83
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Top2bQ64511 1612 aa38,89■■■■□ 3,82
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38,56■■■■□ 3,76
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ubl4bQ9CQ84 188 aa38,55■■■■□ 3,76
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38,48■■■■□ 3,75
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Fmn1Q05860 1466 aa38,42■■■■□ 3,74
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Kif15Q6P9L6 1387 aa38,38■■■■□ 3,74
Gipc1-201ENSMUST00000019577 TnnQ80Z71 1560 aa38,38■■■■□ 3,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa38,23■■■■□ 3,71
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cux2P70298 1426 aa38,11■■■■□ 3,69
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cep164Q5DU05 1446 aa38,02■■■■□ 3,68
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Kif21aQ9QXL2 1672 aa37,57■■■■□ 3,61
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 NrkQ9R0G8 1455 aa37,37■■■■□ 3,57
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gab3Q8BSM5 595 aa37,34■■■■□ 3,57
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Crocc2F6XLV1 1638 aa37,25■■■■□ 3,55
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Duox2A2AQ99 1517 aa37,24■■■■□ 3,55
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Shroom4Q1W617 1475 aa37,23■■■■□ 3,55
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Efcab5A0JP43 1406 aa37,21■■■■□ 3,55
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa37,2■■■■□ 3,55
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa37,19■■■■□ 3,54
Gipc1-201ENSMUST00000019577 PtprkP35822 1457 aa37,15■■■■□ 3,54
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP37,03■■■■□ 3,52
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP36,86■■■■□ 3,49
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ift140E9PY46 1464 aa36,83■■■■□ 3,49
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 SynmQ70IV5 1561 aa36,72■■■■□ 3,47
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP36,7■■■■□ 3,47
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Pla2r1Q62028 1487 aa36,46■■■■□ 3,43
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rusc2Q80U22 1514 aa36,44■■■■□ 3,42
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