RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C YOL057WQ08225 711 aa4.92□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C CCH1P50077 2039 aa4.92□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C KRS1P15180 591 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C IRE1P32361 1115 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C EUG1P32474 517 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C YBL028CP38202 106 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C DSF2P38213 736 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C YJR008WP47085 338 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C DUS4Q06063 367 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C UBX5Q06682 500 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C MET7Q08645 548 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C PSH1Q12161 406 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C LDB19Q12502 818 aa4.91□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C DIT2P21595 489 aa4.9□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C SIS1P25294 352 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C AVT3P36062 692 aa4.9□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C NUP133P36161 1157 aa4.9□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C SET1P38827 1080 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C VAB2P40003 282 aa4.9□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C DNM1P54861 757 aa4.9□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data4.9□□□□□ -1.63not detected
SUP53tL(CAA)C YDR306CQ06640 478 aa4.9□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C RDH54P38086 958 aa4.89□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C CST6P40535 587 aa4.89□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C APL6P46682 809 aa4.89□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C FOL2P51601 243 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C SCS3P53012 380 aa4.89□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C PKC1P24583 1151 aa4.88□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C JHD1P40034 492 aa4.88□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C YIR042CP40586 236 aa4.88□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C RSC8P43609 557 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C YGR122WP53272 402 aa4.88□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C CAN1P04817 590 aa4.87□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C KIN1P13185 1064 aa4.87□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C NOC2P39744 710 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C SKP2P42843 763 aa4.87□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C PSF3Q12146 194 aa4.87□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa4.87□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C GLO3P38682 493 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C NUG1P40010 520 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C VMA2P16140 517 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C RGT1P32862 1170 aa4.85□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C MAM1P40065 302 aa4.85□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C YNL115CP53925 644 aa4.85□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C YML037CQ03703 340 aa4.85□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C PCL8Q08966 492 aa4.85□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C PRD1P25375 712 aa4.84□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data4.84□□□□□ -1.63not detected
SUP53tL(CAA)C SWC3P31376 625 aa4.84□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C TIF4631P39935 952 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C INP52P50942 1183 aa4.84□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C MCM6P53091 1017 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C MTC5Q03897 1148 aa4.84□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C INM2Q05533 292 aa4.84□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SUP53tL(CAA)C PDC1P06169 563 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C MRP7P12687 371 aa4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C PER1P25625 357 aa4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C YUR1P26725 428 aa4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C SLA1P32790 1244 aa4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C MDL2P33311 773 aa4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C YTA12P40341 825 aa4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C RMD1Q03441 430 aa4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C IOC4Q04213 475 aa4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C RTT109Q07794 436 aa4.83□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C RIF1P29539 1916 aa4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data4.82□□□□□ -1.64not detected
SUP53tL(CAA)C URK1P27515 501 aa4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C FMP10P40098 244 aa4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C SRT1Q03175 343 aa4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C EMI2Q04409 500 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C THI22Q06490 572 aa4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C LAP2Q10740 671 aa4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C YLR422WQ06409 1932 aa4.82□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C UTR4P32626 227 aa4.81□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C HAL5P38970 855 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C GPB2P39717 880 aa4.81□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C NOP2P40991 618 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C DAK1P54838 584 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C VPS72Q03388 795 aa4.81□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C BEM2P39960 2167 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C AI2P03876 854 aa4.8□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C UBP12P39538 1254 aa4.8□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C OYE3P41816 400 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C MPP10P47083 593 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C SGM1P47166 707 aa4.8□□□□□ -1.64
SUP53tL(CAA)C GYP7P48365 746 aa4.8□□□□□ -1.64
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