RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C SOG2Q08817 791 aa3.43□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C YLR122CQ12312 125 aa3.43□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C FIR1P40020 876 aa3.43□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C IRC24P40580 263 aa3.43□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C CHS2P14180 963 aa3.42□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C RPB10P22139 70 aa3.42□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C TRP3P00937 484 aa3.42□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data3.42□□□□□ -1.86not detected
HDA3YPR179C YKR073CP36153 106 aa3.42□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C HVG1P0CE11 249 aa3.41□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C FUS1P11710 512 aa3.41□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C PAN5P38787 379 aa3.41□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C AIM46P38885 310 aa3.41□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C YJL181WP46987 611 aa3.41□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C REC8Q12188 680 aa3.41□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C TFA2P36145 328 aa3.4□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C POL5P39985 1022 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C ALD3P54114 506 aa3.4□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data3.4□□□□□ -1.86not detected
HDA3YPR179C TIF6Q12522 245 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C FUR4P05316 633 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C SMC1P32908 1225 aa3.4□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C IRS4P36115 615 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C SPO74P45819 413 aa3.4□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C MAE1P36013 669 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C SUT1P53032 299 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C NCE103P53615 221 aa3.39□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C SPO71Q03868 1245 aa3.39□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C TOS1P38288 455 aa3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C RAD55P38953 406 aa3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C PSY2P40164 858 aa3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C CTH1P47976 325 aa3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C ATG1P53104 897 aa3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C CTR9P89105 1077 aa3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C BRE4Q07660 1125 aa3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C SSA1P10591 642 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C MSB1P21339 1137 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C YGR130CP53278 816 aa3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C RSC4Q02206 625 aa3.38□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C TRL1P09880 827 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C NAM7P30771 971 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C ELM1P32801 640 aa3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C LIP5P32875 414 aa3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C AKR1P39010 764 aa3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C AVT1P47082 602 aa3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C YNR065CP53751 1116 aa3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C MAG2Q06436 670 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C AOS1Q06624 347 aa3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C ELG1Q12050 791 aa3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C GLO4Q12320 285 aa3.37□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C CYC7P00045 113 aa3.36□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C PYC2P32327 1180 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C ACF4P47129 309 aa3.36□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C MNL2Q12205 849 aa3.36□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C QDR1P40475 563 aa3.36□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C YJR124CP47159 448 aa3.36□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C UFD2P54860 961 aa3.36□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C KAR5Q04746 504 aa3.36□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C COBP00163 385 aa3.35□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C PRP5P21372 849 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C GLO3P38682 493 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C FAR11P53917 953 aa3.34□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C HAS1Q03532 505 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C GIC2Q06648 383 aa3.34□□□□□ -1.87
HDA3YPR179C RIM11P38615 370 aa3.34□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C TRS120Q04183 1289 aa3.34□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C ERS1P17261 260 aa3.33□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C CDC3P32457 520 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C DUR3P33413 735 aa3.33□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C GEF1P37020 779 aa3.33□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C NEO1P40527 1151 aa3.33□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C MSH6Q03834 1242 aa3.33□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C FET4P40988 552 aa3.32□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C MDJ2P42834 146 aa3.32□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C SAP155P43612 1002 aa3.32□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C KIP3P53086 805 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C YNL011CP53980 444 aa3.32□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C CDC55Q00362 526 aa3.32□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C YOR223WQ12015 292 aa3.32□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C YLL054CQ12244 843 aa3.32□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C ERP5P38819 212 aa3.31□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C CMR1Q12510 522 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C NPR1P22211 790 aa3.31□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C GCV1P48015 400 aa3.31□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C GPI13Q07830 1017 aa3.31□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C FRT1Q99332 602 aa3.31□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C MMM1P41800 426 aa3.3□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C YIG1Q08956 461 aa3.3□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C FLP1P03870 423 aa3.29□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C UBP5P39944 805 aa3.29□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C NIT1P40447 199 aa3.29□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C CIT3P43635 486 aa3.29□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C ECL1P48235 211 aa3.29□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C BSC2Q05611 235 aa3.29□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C YBL113CQ7M4S9 792 aa3.29□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C SEA4P38164 1038 aa3.29□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C NUT2Q06213 157 aa3.29□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C HTS1P07263 546 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.5 ms