RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C YBL028CP38202 106 aa8.49□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C VAB2P40003 282 aa8.49□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C SNU71P53207 620 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C DAL5P15365 543 aa8.48□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C BOI1P38041 980 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C YIL092WP40497 633 aa8.48□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C PIP2P52960 996 aa8.48□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C ATG1P53104 897 aa8.48□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C DIT2P21595 489 aa8.47□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C MCD4P36051 919 aa8.47□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C LYS14P40971 790 aa8.47□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C FBP1P09201 348 aa8.46□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C GEF1P37020 779 aa8.46□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C YNG2P38806 282 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C VPS62P53285 467 aa8.46□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C NPL4P33755 580 aa8.45□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C GRX7P38068 203 aa8.45□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C CLA4P48562 842 aa8.45□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C ICL2Q12031 575 aa8.44□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C MPH3P0CE00 602 aa8.43□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C PER1P25625 357 aa8.43□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C LDH1P38139 375 aa8.43□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C SPO1P53541 631 aa8.43□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C ECM30Q06673 1274 aa8.43□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C NCB2Q92317 146 aa8.43□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C SPT21P35209 758 aa8.42□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C CST26P38226 397 aa8.42□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C TIF4631P39935 952 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C MXR1P40029 184 aa8.42□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C AIM21P40563 679 aa8.42□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C YJL007CP47080 104 aa8.42□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.42□□□□□ -1.06not detected
SPE3YPR069C ERG12P07277 443 aa8.41□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C YGL242CP53066 181 aa8.41□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C UBX5Q06682 500 aa8.41□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C MOT1P32333 1867 aa8.4□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C SRS2P12954 1174 aa8.4□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C PRE8P23639 250 aa8.4□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C PKC1P24583 1151 aa8.4□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C YGL015CP33199 130 aa8.4□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C YVH1Q02256 364 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SPE3YPR069C UBR2Q07963 1872 aa8.4□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C EUG1P32474 517 aa8.39□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C IOC3P43596 787 aa8.39□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C EAR1Q03212 550 aa8.39□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C LAP2Q10740 671 aa8.39□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C RAD2P07276 1031 aa8.38□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C WHI3P34761 661 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C GPB2P39717 880 aa8.38□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C FIR1P40020 876 aa8.38□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C SKG3Q06315 1026 aa8.38□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C YPL260WQ08977 551 aa8.38□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C KRS1P15180 591 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data8.37□□□□□ -1.07not detected
SPE3YPR069C SRM1P21827 482 aa8.37□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C EPS1P40557 701 aa8.37□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C YFL040WP43562 540 aa8.37□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C MLC1P53141 149 aa8.37□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C YML037CQ03703 340 aa8.37□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C MET7Q08645 548 aa8.37□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C NOT3P06102 836 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C VMA2P16140 517 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C DLD1P32891 587 aa8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C IRC8P47046 822 aa8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C YAF9P53930 226 aa8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C ALO1P54783 526 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C FMP30Q02883 468 aa8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C YPL034WQ03083 165 aa8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C KAR5Q04746 504 aa8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C SUT2Q12286 268 aa8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C YOR131CQ12486 218 aa8.36□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C MYO1P08964 1928 aa8.35□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C UIP5P36137 443 aa8.35□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C MDM20Q12387 796 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C TUS1Q06412 1307 aa8.34□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C RGT1P32862 1170 aa8.34□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C AFG3P39925 761 aa8.34□□□□□ -1.07
SPE3YPR069C ECM21P38167 1117 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C RTS1P38903 757 aa8.33□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C YMR147WP40218 223 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C SOL4P53315 255 aa8.33□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C BRE5P53741 515 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C PDR18P53756 1333 aa8.32□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C PTK2P47116 818 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C YJR107WP47145 328 aa8.32□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C YKR018CP36114 725 aa8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C OSH3P38713 996 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C YHL050CP38721 697 aa8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C BBC1P47068 1157 aa8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C ENP2P48234 707 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21 ms