RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W GYP5Q12344 894 aa11.28□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W KIN1P13185 1064 aa11.27□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W AFG3P39925 761 aa11.27□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W YPL034WQ03083 165 aa11.27□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W PCL8Q08966 492 aa11.27□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W SUT2Q12286 268 aa11.27□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W MAM3Q12296 706 aa11.27□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W WHI3P34761 661 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W KRS1P15180 591 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W SUI2P20459 304 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W NOP2P40991 618 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W AHC1Q12433 566 aa11.24□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W HIP1P06775 603 aa11.23□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W PIP2P52960 996 aa11.23□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W UBX5Q06682 500 aa11.23□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W ECM29P38737 1868 aa11.23□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data11.22□□□□□ -0.61not detected
YLR349WYLR349W BOI1P38041 980 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W SNU71P53207 620 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W LAP2Q10740 671 aa11.22□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W EUG1P32474 517 aa11.21□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W YFL040WP43562 540 aa11.21□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W YJR107WP47145 328 aa11.21□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa11.21□□□□□ -0.61
YLR349WYLR349W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W MET7Q08645 548 aa11.2□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W PIF1P07271 859 aa11.19□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W DIT2P21595 489 aa11.19□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W KTR2P33550 425 aa11.19□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W GRX7P38068 203 aa11.19□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W CST26P38226 397 aa11.19□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W MXR1P40029 184 aa11.19□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W PKC1P24583 1151 aa11.18□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W BCS1P32839 456 aa11.18□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W AIM21P40563 679 aa11.18□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W YML037CQ03703 340 aa11.18□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W DUS4Q06063 367 aa11.18□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W VMA2P16140 517 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W FMP30Q02883 468 aa11.16□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W MPH3P0CE00 602 aa11.15□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W MIP1P15801 1254 aa11.15□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W PER1P25625 357 aa11.15□□□□□ -0.62
YLR349WYLR349W CYB2P00175 591 aa11.14□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W TUS1Q06412 1307 aa11.13□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W ERG12P07277 443 aa11.13□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W DBP1P24784 617 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W RGT1P32862 1170 aa11.12□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W GPB2P39717 880 aa11.11□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W PRE8P23639 250 aa11.1□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W RMD1Q03441 430 aa11.1□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W UBR2Q07963 1872 aa11.1□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W MSC7P38694 644 aa11.09□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
YLR349WYLR349W SRM1P21827 482 aa11.08□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W SPO1P53541 631 aa11.08□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W YPL260WQ08977 551 aa11.08□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W DAL5P15365 543 aa11.07□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W UTR4P32626 227 aa11.07□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W TFA1P36100 482 aa11.07□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W YHR131CP38835 850 aa11.07□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa11.07□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W YNG2P38806 282 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W ILV3P39522 585 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W NOC2P39744 710 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W SKP2P42843 763 aa11.05□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W NPL4P33755 580 aa11.04□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa11.04□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W RPP0P05317 312 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W SAM1P10659 382 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W SAM2P19358 384 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W CHS3P29465 1165 aa11.03□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W VPS27P40343 622 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W SCS3P53012 380 aa11.03□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W YGR125WP53273 1036 aa11.03□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W YAF9P53930 226 aa11.03□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W SKG3Q06315 1026 aa11.03□□□□□ -0.64
YLR349WYLR349W CDC19P00549 500 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W GRS1P38088 690 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W TOM71P38825 639 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.6 ms