RNA–Protein interactions for RNA: YJR147W

HMS2, Transcript of Protein with similarity to heat shock transcription factors, yeast

Gene HMS2, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS2	YJR147W	SVF1	Q05515	481 aa		7.37	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	SAC3	P46674	1301 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	BRF1	P29056	596 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	SCT1	P32784	759 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	YJL007C	P47080	104 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	PEX21	P50091	288 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	SPO19	Q03029	223 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	YRR1	Q12172	810 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	CLN1	P20437	546 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	MRPS28	P21771	286 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	CPS1	P27614	576 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	GRX4	P32642	244 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	PPX1	P38698	397 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	MEP1	P40260	492 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	MPH1	P40562	993 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	GPI8	P49018	411 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	PHM6	Q05637	104 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	SRS2	P12954	1174 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	NUF2	P33895	451 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	SAS3	P34218	831 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	FUI1	P38196	639 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	KIC1	P38692	1080 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	IPL1	P38991	367 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	RSM25	P40496	264 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	TIM54	P47045	478 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	SHE4	P51534	789 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	ARP5	P53946	755 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	MTC5	Q03897	1148 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	CEX1	Q12453	761 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HMS2	YJR147W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	PHO87	P25360	923 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	PES4	P39684	611 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.33	□□□□□ -1.24	not detected
HMS2	YJR147W	BFA1	P47113	574 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	YPL062W	Q02781	134 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	ERG12	P07277	443 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	KEX2	P13134	814 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	PKC1	P24583	1151 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	MSH1	P25846	959 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	RPC37	P36121	282 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	STR2	P47164	639 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	BTN2	P53286	410 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	YDR090C	Q03193	310 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	UBX2	Q04228	584 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	VPS5	Q92331	675 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	NUP145	P49687	1317 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	BIO2	P32451	375 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	PIM1	P36775	1133 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	ATF2	P53296	535 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.31	□□□□□ -1.24	RIP-Chip
HMS2	YJR147W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.31	□□□□□ -1.24	not detected
HMS2	YJR147W	RSC2	Q06488	889 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	SLP1	Q12232	587 aa		7.31	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	CIT2	P08679	460 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	JNM1	P36224	373 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	ATG32	P40458	529 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	ISM1	P48526	1002 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	KEL2	P50090	882 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	RIA1	P53893	1110 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	VTC3	Q02725	835 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	TLG2	Q08144	397 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	INH1	P01097	85 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	SIT4	P20604	311 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	BDH2	P39713	417 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	INP2	Q03824	705 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	KAR5	Q04746	504 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	CSC1	Q06538	782 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	YDL144C	Q07589	356 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	GRC3	Q07845	632 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HMS2	YJR147W	APC5	Q08683	685 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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