RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP26,76■■□□□ 1,88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FanciQ8K368 1330 aa26,76■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gli3Q61602 1583 aa26,75■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PzpQ61838 1495 aa26,75■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cps1Q8C196 1500 aa26,75■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NudcO35685 332 aaKnown RBP26,74■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ecm2Q5FW85 670 aa26,74■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adgrl1Q80TR1 1466 aa26,73■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa26,73■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zranb1Q7M760 708 aa26,72■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CanxP35564 591 aaKnown RBP26,7■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnai1Q8C0M8 701 aa26,7■■□□□ 1,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chmp5Q9D7S9 219 aa26,69■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IghaA0A0A6YXW6 389 aa26,68■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrbnQ8C7D2 445 aa26,68■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pik3r4Q8VD65 1358 aa26,67■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arap3Q8R5G7 1538 aa26,66■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rapgef3Q8VCC8 918 aa26,66■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp19Q3UJD6 1360 aa26,66■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP26,66■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP26,66■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp32F8VPZ3 1604 aa26,65■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ralbp1Q62172 648 aa26,65■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pdlim2Q8R1G6 349 aa26,64■■□□□ 1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NinlQ6ZQ12 1394 aa26,63■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP26,63■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc30Q8BVF4 654 aa26,62■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP26,61■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa26,61■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa26,59■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Map3k19E9Q3S4 1311 aa26,59■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa26,58■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Golga2Q921M4 999 aa26,58■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP26,58■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa26,58■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf521Q6KAS7 1311 aa26,58■■□□□ 1,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 B4galnt3Q6L8S8 986 aa26,57■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP26,57■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GsdmaQ9EST1 446 aa26,57■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DaxxO35613 739 aa26,56■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP26,56■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hspa1lP16627 641 aa26,55■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ipo8Q7TMY7 1010 aa26,55■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26,54■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP26,54■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Uspl1Q3ULM6 1089 aa26,54■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif1aP33173 1695 aa26,54■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP26,54■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Idi2Q8BFZ6 227 aa26,53■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P2rx7Q9Z1M0 595 aa26,53■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PtpruB1AUH1 1446 aa26,52■■□□□ 1,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa26,51■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP26,5■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4933416C03RikQ3V063 378 aa26,49■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf316Q6PGE4 1016 aa26,49■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Iqsec2Q5DU25 1478 aa26,48■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q3UJC8 639 aa26,47■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam135bQ9DAI6 1403 aa26,47■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP26,46■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim58Q5NCC9 485 aa26,45■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sirt1Q923E4 737 aa26,45■■□□□ 1,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tsen2Q6P7W5 460 aa26,44■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Med1Q925J9 1575 aa26,43■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CatipB9EKE5 520 aa26,42■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dbr1Q923B1 550 aa26,42■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP26,42■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 C5P06684 1680 aa26,41■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl11bQ99PV8 884 aa26,41■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ak7Q9D2H2 614 aa26,41■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc183A2AJB1 534 aa26,4■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Neurod2Q62414 383 aa26,4■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Htatsf1Q8BGC0 757 aa26,4■■□□□ 1,82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Als2Q920R0 1651 aa26,38■■□□□ 1,81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP26,37■■□□□ 1,81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mon2Q80TL7 1715 aa26,35■■□□□ 1,81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26,35■■□□□ 1,81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP26,34■■□□□ 1,81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atl3Q91YH5 541 aa26,33■■□□□ 1,81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa26,33■■□□□ 1,81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim30dE9PWL0 497 aa26,32■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Birc3O08863 600 aa26,32■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspyl2Q7TQI8 677 aa26,32■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim28Q62318 834 aa26,32■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa26,31■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apbb1Q9QXJ1 710 aa26,31■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf335A2A5K6 1337 aa26,3■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP26,3■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hs1bp3Q3TC93 395 aa26,3■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Astn2Q80Z10 1352 aa26,29■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ipo4Q8VI75 1082 aa26,29■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hoxb7P09024 217 aa26,28■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa26,28■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apaf1O88879 1249 aa26,27■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r15aP17564 657 aa26,27■■□□□ 1,8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NgefQ8CHT1 710 aa26,26■■□□□ 1,79
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa26,25■■□□□ 1,79
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10563F6WIE4 79 aa26,25■■□□□ 1,79
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc12a5Q91V14 1138 aa26,25■■□□□ 1,79
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf541Q0GGX2 1363 aa26,24■■□□□ 1,79
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mdc1Q5PSV9 1707 aa26,24■■□□□ 1,79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,8 ms