RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PzpQ61838 1495 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cps1Q8C196 1500 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NudcO35685 332 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ecm2Q5FW85 670 aa26.74■■□□□ 1.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adgrl1Q80TR1 1466 aa26.73■■□□□ 1.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa26.73■■□□□ 1.87
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrbnQ8C7D2 445 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pik3r4Q8VD65 1358 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arap3Q8R5G7 1538 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rapgef3Q8VCC8 918 aa26.66■■□□□ 1.86
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Map3k19E9Q3S4 1311 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa26.58■■□□□ 1.85
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf521Q6KAS7 1311 aa26.58■■□□□ 1.85
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ipo8Q7TMY7 1010 aa26.55■■□□□ 1.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Uspl1Q3ULM6 1089 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif1aP33173 1695 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Idi2Q8BFZ6 227 aa26.53■■□□□ 1.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P2rx7Q9Z1M0 595 aa26.53■■□□□ 1.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PtpruB1AUH1 1446 aa26.52■■□□□ 1.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa26.51■■□□□ 1.83
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf316Q6PGE4 1016 aa26.49■■□□□ 1.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Iqsec2Q5DU25 1478 aa26.48■■□□□ 1.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q3UJC8 639 aa26.47■■□□□ 1.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam135bQ9DAI6 1403 aa26.47■■□□□ 1.83
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim58Q5NCC9 485 aa26.45■■□□□ 1.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sirt1Q923E4 737 aa26.45■■□□□ 1.83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tsen2Q6P7W5 460 aa26.44■■□□□ 1.82
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CatipB9EKE5 520 aa26.42■■□□□ 1.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dbr1Q923B1 550 aa26.42■■□□□ 1.82
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 C5P06684 1680 aa26.41■■□□□ 1.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl11bQ99PV8 884 aa26.41■■□□□ 1.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ak7Q9D2H2 614 aa26.41■■□□□ 1.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc183A2AJB1 534 aa26.4■■□□□ 1.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Neurod2Q62414 383 aa26.4■■□□□ 1.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Htatsf1Q8BGC0 757 aa26.4■■□□□ 1.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Als2Q920R0 1651 aa26.38■■□□□ 1.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mon2Q80TL7 1715 aa26.35■■□□□ 1.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26.35■■□□□ 1.81
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atl3Q91YH5 541 aa26.33■■□□□ 1.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa26.33■■□□□ 1.81
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Birc3O08863 600 aa26.32■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspyl2Q7TQI8 677 aa26.32■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim28Q62318 834 aa26.32■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa26.31■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apbb1Q9QXJ1 710 aa26.31■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf335A2A5K6 1337 aa26.3■■□□□ 1.8
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hs1bp3Q3TC93 395 aa26.3■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Astn2Q80Z10 1352 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ipo4Q8VI75 1082 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hoxb7P09024 217 aa26.28■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa26.28■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apaf1O88879 1249 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r15aP17564 657 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NgefQ8CHT1 710 aa26.26■■□□□ 1.79
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10563F6WIE4 79 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc12a5Q91V14 1138 aa26.25■■□□□ 1.79
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mdc1Q5PSV9 1707 aa26.24■■□□□ 1.79
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