Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMY7

Ipo8, Importin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,010 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo8Q7TMY7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Ipo8Q7TMY7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,67■■■■■ 4,42
Ipo8Q7TMY7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,24■■■■■ 4,19
Ipo8Q7TMY7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,19
Ipo8Q7TMY7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,11■■■■■ 4,01
Ipo8Q7TMY7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Ipo8Q7TMY7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Ipo8Q7TMY7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Ipo8Q7TMY7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Ipo8Q7TMY7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Ipo8Q7TMY7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Ipo8Q7TMY7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,72
Ipo8Q7TMY7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Ipo8Q7TMY7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Ipo8Q7TMY7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Ipo8Q7TMY7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,87■■■■□ 3,65
Ipo8Q7TMY7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,79■■■■□ 3,64
Ipo8Q7TMY7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Ipo8Q7TMY7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Ipo8Q7TMY7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Ipo8Q7TMY7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Ipo8Q7TMY7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,21■■■■□ 3,55
Ipo8Q7TMY7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Ipo8Q7TMY7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Ipo8Q7TMY7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Ipo8Q7TMY7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Ipo8Q7TMY7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Ipo8Q7TMY7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Ipo8Q7TMY7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,75■■■■□ 3,47
Ipo8Q7TMY7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,66■■■■□ 3,46
Ipo8Q7TMY7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Ipo8Q7TMY7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Ipo8Q7TMY7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,58■■■■□ 3,45
Ipo8Q7TMY7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,53■■■■□ 3,44
Ipo8Q7TMY7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Ipo8Q7TMY7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Ipo8Q7TMY7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Ipo8Q7TMY7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,17■■■■□ 3,38
Ipo8Q7TMY7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Ipo8Q7TMY7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Ipo8Q7TMY7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Ipo8Q7TMY7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Ipo8Q7TMY7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Ipo8Q7TMY7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Ipo8Q7TMY7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Ipo8Q7TMY7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,87■■■■□ 3,33
Ipo8Q7TMY7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,83■■■■□ 3,33
Ipo8Q7TMY7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Ipo8Q7TMY7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,74■■■■□ 3,31
Ipo8Q7TMY7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Ipo8Q7TMY7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Ipo8Q7TMY7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Ipo8Q7TMY7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Ipo8Q7TMY7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Ipo8Q7TMY7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Ipo8Q7TMY7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Ipo8Q7TMY7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Ipo8Q7TMY7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Ipo8Q7TMY7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Ipo8Q7TMY7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Ipo8Q7TMY7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Ipo8Q7TMY7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Ipo8Q7TMY7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Ipo8Q7TMY7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,07■■■■□ 3,2
Ipo8Q7TMY7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,07■■■■□ 3,2
Ipo8Q7TMY7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Ipo8Q7TMY7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Ipo8Q7TMY7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Ipo8Q7TMY7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Ipo8Q7TMY7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Ipo8Q7TMY7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Ipo8Q7TMY7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Ipo8Q7TMY7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,76■■■■□ 3,16
Ipo8Q7TMY7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Ipo8Q7TMY7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Ipo8Q7TMY7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Ipo8Q7TMY7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Ipo8Q7TMY7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Ipo8Q7TMY7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Ipo8Q7TMY7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Ipo8Q7TMY7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Ipo8Q7TMY7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Ipo8Q7TMY7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Ipo8Q7TMY7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Ipo8Q7TMY7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Ipo8Q7TMY7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Ipo8Q7TMY7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Ipo8Q7TMY7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ipo8Q7TMY7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ipo8Q7TMY7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Ipo8Q7TMY7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Ipo8Q7TMY7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3,03
Ipo8Q7TMY7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Ipo8Q7TMY7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Ipo8Q7TMY7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Ipo8Q7TMY7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Ipo8Q7TMY7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Ipo8Q7TMY7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Ipo8Q7TMY7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3,01
Ipo8Q7TMY7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms