RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa28.18■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adamts7Q68SA9 1657 aa28.18■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AampJ3QN89 436 aa28.18■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Qser1A2BIE1 1698 aa28.16■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q9D9H8 365 aa28.16■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NinlQ6ZQ12 1394 aa28.15■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm6268A2A3U9 297 aa28.15■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gsto1O09131 240 aa28.15■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CastP51125 788 aa28.15■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm156Q58A37 223 aa28.14■■■□□ 2.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdk19Q8BWD8 501 aa28.14■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtprmP28828 1452 aa28.14■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf330Q922H9 316 aa28.13■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irx3P81067 507 aa28.12■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa28.12■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cavin4A2AMM0 362 aa28.1■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AU019823E9PUQ3 292 aa28.09■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa28.09■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc60Q8C4J0 545 aa28.09■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc12a5Q91V14 1138 aa28.09■■■□□ 2.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atl3Q91YH5 541 aa28.08■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa28.07■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankrd50F7BE84 1390 aa28.07■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef28P97433 1693 aa28.06■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sptbn5F6UCX4 1208 aa28.05■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PalmQ9Z0P4 383 aa28.04■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abca14E9Q8F8 1683 aa28.04■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdlim2Q8R1G6 349 aa28.03■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nutm1Q8BHP2 1126 aa28.03■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa28.02■■■□□ 2.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q4VA45 678 aa28■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ciz1Q8VEH2 845 aa28■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa28■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif13aQ9EQW7 1749 aa28■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa27.99■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Afap1Q80YS6 731 aa27.99■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nectin2P32507 530 aa27.98■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rabep1O35551 862 aa27.98■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NktrP30415 1453 aa27.97■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Swt1Q9DBQ9 907 aa27.97■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PaskQ8CEE6 1383 aa27.96■■■□□ 2.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pik3r4Q8VD65 1358 aa27.94■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Birc3O08863 600 aa27.94■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim28Q62318 834 aa27.94■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmco5bQ80X59 307 aa27.93■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa27.93■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naip7Q9JIB3 1402 aa27.93■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Asxl2Q8BZ32 1370 aa27.93■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map3k19E9Q3S4 1311 aa27.92■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FanciQ8K368 1330 aa27.91■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fchsd2Q3USJ8 740 aa27.91■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf316Q6PGE4 1016 aa27.91■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Htatsf1Q8BGC0 757 aa27.9■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif18aQ91WD7 886 aa27.9■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf541Q0GGX2 1363 aa27.9■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp32F8VPZ3 1604 aa27.9■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hs1bp3Q3TC93 395 aa27.89■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa27.89■■■□□ 2.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aplp1Q03157 653 aa27.88■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa27.88■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa27.88■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif2cQ922S8 721 aa27.87■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp7bQ64446 1462 aa27.87■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map7O88735 730 aa27.86■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SkilQ60665 675 aa27.86■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cog6Q8R3I3 657 aa27.86■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhg1F6S200 1446 aa27.85■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nsd3Q6P2L6 1439 aa27.85■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q3UPC7 1272 aa27.85■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PplQ9R269 1755 aa27.84■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vamp4O70480 141 aa27.84■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Synj2Q9D2G5 1434 aa27.83■■■□□ 2.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mcm10Q0VBD2 885 aa27.82■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp1r15aP17564 657 aa27.82■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa27.82■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nwd1A6H603 1563 aa27.81■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa27.81■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Catsper2A2ARP9 588 aa27.8■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plcd4Q8K3R3 807 aa27.8■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa27.79■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa27.78■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spryd3E9Q9B3 442 aa27.78■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Antxr1Q9CZ52 562 aa27.78■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plin1Q8CGN5 517 aa27.77■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MvpQ9EQK5 861 aa27.77■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cabp2Q9JLK4 216 aa27.77■■■□□ 2.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gnai1B2RSH2 354 aa27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 86.4 ms