RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TnikP83510 1323 aa25.8■■□□□ 1.72
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif1aP33173 1695 aa25.78■■□□□ 1.72
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Birc3O08863 600 aa25.77■■□□□ 1.72
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim28Q62318 834 aa25.76■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc12a5Q91V14 1138 aa25.75■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q3UJC8 639 aa25.75■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CatipB9EKE5 520 aa25.74■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Liat1Q810M6 228 aa25.74■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa25.73■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dusp27Q148W8 1138 aa25.72■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PalmQ9Z0P4 383 aa25.7■■□□□ 1.71
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sirt1Q923E4 737 aa25.67■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa25.67■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf541Q0GGX2 1363 aa25.67■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp1r15aP17564 657 aa25.67■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ksr2Q3UVC0 959 aa25.67■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa25.66■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cavin4A2AMM0 362 aa25.65■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Topaz1E5FYH1 1653 aa25.65■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa25.64■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Polr3glQ8R0C0 218 aa25.64■■□□□ 1.7
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ecm2Q5FW85 670 aa25.64■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NgefQ8CHT1 710 aa25.63■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fchsd2Q3USJ8 740 aa25.62■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa25.62■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abcc10Q8R4P9 1501 aa25.61■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa25.61■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q4VA45 678 aa25.61■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim26Q99PN3 545 aa25.61■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pank1Q8K4K6 548 aa25.6■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ciz1Q8VEH2 845 aa25.6■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C5P06684 1680 aa25.6■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Astn2Q80Z10 1352 aa25.59■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PaskQ8CEE6 1383 aa25.59■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hoxb7P09024 217 aa25.59■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pak3Q61036 559 aa25.59■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tspyl2Q7TQI8 677 aa25.59■■□□□ 1.69
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sox12Q04890 314 aa25.57■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rsph6aQ8CDR2 708 aa25.57■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Als2Q920R0 1651 aa25.57■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Idi1P58044 227 aa25.56■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim58Q5NCC9 485 aa25.55■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf335A2A5K6 1337 aa25.55■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm10563F6WIE4 79 aa25.54■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa25.54■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Swt1Q9DBQ9 907 aa25.54■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mon2Q80TL7 1715 aa25.53■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp7bQ64446 1462 aa25.53■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spef2Q8C9J3 1734 aa25.53■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam135bQ9DAI6 1403 aa25.53■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ankrd50F7BE84 1390 aa25.53■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pik3c2aQ61194 1686 aa25.52■■□□□ 1.68
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Med1Q925J9 1575 aa25.51■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem94Q7TSH8 1360 aa25.51■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf521Q6KAS7 1311 aa25.5■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rims2Q9EQZ7 1530 aa25.5■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NalcnQ8BXR5 1738 aa25.5■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mcm10Q0VBD2 885 aa25.5■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CastP51125 788 aa25.49■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Egfem1Q8C088 590 aa25.49■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ttll13A4Q9F6 804 aa25.48■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif4a2P10630 407 aa25.48■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CemipQ8BI06 1361 aa25.47■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 B4galnt3Q6L8S8 986 aa25.46■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Col16a1Q8BLX7 1580 aa25.46■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mdc1Q5PSV9 1707 aa25.46■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa25.46■■□□□ 1.67
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ubr1O70481 1757 aa25.45■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cabp2Q9JLK4 216 aa25.44■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zmym3Q9JLM4 1370 aa25.44■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C3P01027 1663 aa25.43■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ap3b2Q9JME5 1082 aa25.43■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plin1Q8CGN5 517 aa25.43■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MpripP97434 1024 aa25.42■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dbr1Q923B1 550 aa25.41■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa25.41■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dennd6aQ8BH65 605 aa25.41■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc60Q8C4J0 545 aa25.41■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa25.41■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa25.4■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Map2P20357 1828 aa25.4■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NudcO35685 332 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 FancaQ9JL70 1439 aa25.39■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scn7aB1AYL1 1681 aa25.39■■□□□ 1.66
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Camta1A2A891 1682 aa25.39■■□□□ 1.65
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa25.38■■□□□ 1.65
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa25.38■■□□□ 1.65
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tns3Q5SSZ5 1440 aa25.38■■□□□ 1.65
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nlgn1Q99K10 843 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.8 ms