RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C MTO1P53070 669 aa7.77□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C YDL176WQ12027 708 aa7.77□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C SPR3P41901 512 aa7.76□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C CAF120P53836 1060 aa7.76□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C DIT1P21623 536 aa7.75□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C STM1P39015 273 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C MRPL16P38064 232 aa7.74□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C HXT8P40886 569 aa7.74□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C CUZ1P53899 274 aa7.74□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C SUT1P53032 299 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C YOR296WQ08748 1289 aa7.73□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C STB3Q12427 513 aa7.73□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C MSN1P22148 382 aa7.72□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C SLD2P34252 453 aa7.72□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PFA4YOL003C RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data7.71□□□□□ -1.18not detected
PFA4YOL003C YHL050CP38721 697 aa7.71□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C YHR219WP38900 624 aa7.71□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C UFD2P54860 961 aa7.71□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C NUT2Q06213 157 aa7.71□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C SMC1P32908 1225 aa7.7□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C GIP1P38229 639 aa7.7□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C TRS120Q04183 1289 aa7.7□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa7.7□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C FRT1Q99332 602 aa7.7□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C ISW1P38144 1129 aa7.69□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C BSD2P38356 321 aa7.69□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C RGD2P43556 714 aa7.69□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C PPX1P38698 397 aa7.68□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C APM2P38700 605 aa7.68□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C NTA1P40354 457 aa7.68□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C MNL2Q12205 849 aa7.68□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data7.67□□□□□ -1.18not detected
PFA4YOL003C SEC20P28791 383 aa7.67□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C ITC1P53125 1264 aa7.67□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C YNR040WP53736 256 aa7.67□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C SYT1Q06836 1226 aa7.67□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C MSC7P38694 644 aa7.66□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C RAD55P38953 406 aa7.66□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C CEM1P39525 442 aa7.66□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C FIR1P40020 876 aa7.66□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C NCL1P38205 684 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C YBR287WP38355 427 aa7.65□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C HEH2Q03281 663 aa7.65□□□□□ -1.18
PFA4YOL003C FPS1P23900 669 aa7.64□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C IPL1P38991 367 aa7.64□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C LYS5P50113 272 aa7.64□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C ADE12P80210 433 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C RSC4Q02206 625 aa7.64□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C GPI13Q07830 1017 aa7.64□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C IRS4P36115 615 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C TIF6Q12522 245 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C YER156CP40093 338 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C PSY2P40164 858 aa7.62□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C YIL165CP40446 119 aa7.62□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C WHI5Q12416 295 aa7.62□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C JJJ3P47138 172 aa7.61□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C YNL011CP53980 444 aa7.61□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C CDC55Q00362 526 aa7.61□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C HEM3P28789 327 aa7.6□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C HPF1Q05164 967 aa7.6□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C IDI1P15496 288 aa7.59□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C AIM46P38885 310 aa7.59□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C DPH6Q12429 685 aa7.59□□□□□ -1.19
PFA4YOL003C MET4P32389 672 aa7.58□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C YPL062WQ02781 134 aa7.58□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C PRK1P40494 810 aa7.57□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C YGR035CP53222 116 aa7.57□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C BSC2Q05611 235 aa7.55□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C RSC2Q06488 889 aa7.55□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C GPM1P00950 247 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C PHO4P07270 312 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C THI12P42883 340 aa7.53□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C THI5P43534 340 aa7.53□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C THI11P47183 340 aa7.53□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C PPT1P53043 513 aa7.53□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C CTR9P89105 1077 aa7.53□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C THI13Q07748 340 aa7.53□□□□□ -1.2
PFA4YOL003C PDC5P16467 563 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C KNS1P32350 737 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C SAM37P50110 327 aa7.52□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C PYC2P32327 1180 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C MRP10O75012 95 aa7.5□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C COBP00163 385 aa7.5□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C FLP1P03870 423 aa7.49□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C ASF1P32447 279 aa7.49□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C GCD6P32501 712 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C VPS35P34110 944 aa7.49□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C POL32P47110 350 aa7.49□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C ALD3P54114 506 aa7.49□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PFA4YOL003C FUS1P11710 512 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.4 ms