RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W STB3Q12427 513 aa7.49□□□□□ -1.21
YLL047WYLL047W LDH1P38139 375 aa7.48□□□□□ -1.21
YLL047WYLL047W JJJ3P47138 172 aa7.48□□□□□ -1.21
YLL047WYLL047W SYT1Q06836 1226 aa7.47□□□□□ -1.21
YLL047WYLL047W BOI1P38041 980 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W YBR287WP38355 427 aa7.46□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W YGR035CP53222 116 aa7.46□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W HEH2Q03281 663 aa7.46□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W YOR296WQ08748 1289 aa7.46□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W FPS1P23900 669 aa7.45□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W ACF4P47129 309 aa7.45□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W HPF1Q05164 967 aa7.45□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W NCL1P38205 684 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W GIP1P38229 639 aa7.44□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W HXT8P40886 569 aa7.44□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W TRL1P09880 827 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W ISW1P38144 1129 aa7.43□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W APM2P38700 605 aa7.43□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W HAT1Q12341 374 aa7.43□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W SMC1P32908 1225 aa7.42□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W KTR2P33550 425 aa7.42□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W GLO3P38682 493 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W UFD2P54860 961 aa7.42□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W ADE12P80210 433 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W QDR1P40475 563 aa7.41□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W YBL113CQ7M4S9 792 aa7.41□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W RPB10P22139 70 aa7.4□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W MSN1P22148 382 aa7.4□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W MSC7P38694 644 aa7.4□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W ERP5P38819 212 aa7.4□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W FIR1P40020 876 aa7.4□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W YER156CP40093 338 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
YLL047WYLL047W NTA1P40354 457 aa7.39□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W BSD2P38356 321 aa7.38□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W SUT1P53032 299 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W STM1P39015 273 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W ITC1P53125 1264 aa7.37□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W TRK2P28584 889 aa7.36□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W MDJ2P42834 146 aa7.36□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W TRS120Q04183 1289 aa7.36□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W RSC2Q06488 889 aa7.36□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W GPM1P00950 247 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W GRS1P38088 690 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W RAD55P38953 406 aa7.35□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W RGD2P43556 714 aa7.35□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W IRS4P36115 615 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W YIL165CP40446 119 aa7.34□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W YNR040WP53736 256 aa7.34□□□□□ -1.23
YLL047WYLL047W IDI1P15496 288 aa7.33□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W PDC5P16467 563 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data7.33□□□□□ -1.24not detected
YLL047WYLL047W PRK1P40494 810 aa7.33□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W SEC20P28791 383 aa7.32□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W SLD2P34252 453 aa7.32□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W PPX1P38698 397 aa7.32□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W AIM46P38885 310 aa7.31□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W PSY2P40164 858 aa7.31□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W RSC4Q02206 625 aa7.31□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W YML020WQ03722 664 aa7.31□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W NUT2Q06213 157 aa7.31□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W AI1P03875 834 aa7.29□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W CDC55Q00362 526 aa7.29□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W MNL2Q12205 849 aa7.29□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W YHL050CP38721 697 aa7.28□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W YHR219WP38900 624 aa7.28□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W FRT1Q99332 602 aa7.28□□□□□ -1.24
YLL047WYLL047W MET1P36150 593 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W PPT1P53043 513 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W YNL011CP53980 444 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W SLP1Q12232 587 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W FUS1P11710 512 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W GIS4Q04233 774 aa7.23□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W BSC2Q05611 235 aa7.23□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W LEM3P42838 414 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W SAM37P50110 327 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W SOG2Q08817 791 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W PHM7Q12252 991 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL047WYLL047W INP51P40559 946 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W MSH6Q03834 1242 aa7.21□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W GPI13Q07830 1017 aa7.21□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W NAR1P23503 491 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W GCD6P32501 712 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W YFL066CP43538 392 aa7.2□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W GUP1P53154 560 aa7.2□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W BIO5P53744 561 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W ALD3P54114 506 aa7.2□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W NHA1Q99271 985 aa7.2□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W ALG14P38242 237 aa7.19□□□□□ -1.26
YLL047WYLL047W CIC1P38779 376 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.4 ms