RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa16.58■□□□□ 0.25
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa16.53■□□□□ 0.24
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa16.43■□□□□ 0.22
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Atp10bB1AWN4 1474 aa16.4■□□□□ 0.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmem2Q5FWI3 1383 aa16.4■□□□□ 0.22
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa16.4■□□□□ 0.22
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ubap1lG3UW59 384 aa16.37■□□□□ 0.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Idi1P58044 227 aa16.37■□□□□ 0.21
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa16.37■□□□□ 0.21
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ltbp1Q8CG19 1712 aa16.33■□□□□ 0.21
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Shank2Q80Z38 1476 aa16.33■□□□□ 0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 C5P06684 1680 aa16.32■□□□□ 0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wdr17E9Q271 1322 aa16.31■□□□□ 0.2
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Als2Q920R0 1651 aa16.29■□□□□ 0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cep170bQ80U49 1574 aa16.29■□□□□ 0.2
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dixdc1Q80Y83 711 aa16.28■□□□□ 0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rims1Q99NE5 1463 aa16.28■□□□□ 0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Txnrd1Q9JMH6 613 aa16.28■□□□□ 0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pola1P33609 1465 aa16.27■□□□□ 0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc129Q14B48 1034 aa16.27■□□□□ 0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nrxn1Q9CS84 1514 aa16.26■□□□□ 0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rtl5Q5DTT4 599 aa16.26■□□□□ 0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ap3b2Q9JME5 1082 aa16.26■□□□□ 0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fan1Q69ZT1 1020 aa16.25■□□□□ 0.19
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zmym3Q9JLM4 1370 aa16.23■□□□□ 0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dot1lQ6XZL8 1540 aa16.23■□□□□ 0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nfat5Q9WV30 1534 aa16.23■□□□□ 0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Abca15E9PWH4 1668 aa16.22■□□□□ 0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Os9Q8K2C7 672 aa16.22■□□□□ 0.19
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc35g1Q8BY79 368 aa16.2■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Polr3aB2RXC6 1390 aa16.2■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pkd2O35245 966 aa16.19■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ZgpatQ8VDM1 511 aa16.19■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plekhg1F6S200 1446 aa16.19■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fyb1O35601 819 aa16.19■□□□□ 0.18
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Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa16.19■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Col16a1Q8BLX7 1580 aa16.18■□□□□ 0.18
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