RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Txndc2Q6P902 515 aa25.43■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cnga1P29974 684 aa25.42■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa25.42■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif7B7ZNG0 1348 aa25.41■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Q7TT23 1179 aa25.4■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dip2bQ3UH60 1574 aa25.4■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa25.4■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dcaf11Q91VU6 549 aa25.4■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mink1Q9JM52 1308 aa25.37■■□□□ 1.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Abca14E9Q8F8 1683 aa25.37■■□□□ 1.65
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa25.33■■□□□ 1.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slit3Q9WVB4 1523 aa25.32■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Asxl2Q8BZ32 1370 aa25.32■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Csrnp3P59055 597 aa25.32■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 KdrP35918 1367 aa25.31■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ofd1Q80Z25 1017 aa25.31■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atf7ipQ7TT18 1306 aa25.31■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gsto1O09131 240 aa25.29■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nrxn1Q9CS84 1514 aa25.28■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nlrp6Q91WS2 869 aa25.27■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cdk19Q8BWD8 501 aa25.26■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PzpQ61838 1495 aa25.26■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NktrP30415 1453 aa25.25■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa25.25■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bcl9Q9D219 1425 aa25.24■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 FanciQ8K368 1330 aa25.24■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa25.23■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cps1Q8C196 1500 aa25.23■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 IghaA0A0A6YXW6 389 aa25.2■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pik3r4Q8VD65 1358 aa25.2■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Adgrl1Q80TR1 1466 aa25.2■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zranb1Q7M760 708 aa25.17■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arap3Q8R5G7 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MyclP10166 368 aa25.16■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa25.14■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Esx1O88933 382 aa25.13■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp32F8VPZ3 1604 aa25.11■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Calr4Q3TQS0 420 aa25.09■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NinlQ6ZQ12 1394 aa25.09■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Alpk3Q924C5 1678 aa25.09■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Map3k19E9Q3S4 1311 aa25.08■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Topaz1E5FYH1 1653 aa25.08■■□□□ 1.6
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa25.05■■□□□ 1.6
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa25.04■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PtpruB1AUH1 1446 aa25.02■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 GsdmaQ9EST1 446 aa25.01■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Aplp2Q06335 707 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Golga2Q921M4 999 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif16bB1AVY7 1312 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sirt1Q923E4 737 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kank1E9Q238 1360 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Q3UJC8 639 aa24.99■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp19Q3UJD6 1360 aa24.99■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 L3mbtl2P59178 703 aa24.98■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CrbnQ8C7D2 445 aa24.98■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 P2rx7Q9Z1M0 595 aa24.98■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf316Q6PGE4 1016 aa24.97■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa24.96■■□□□ 1.59
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif1aP33173 1695 aa24.95■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CatipB9EKE5 520 aa24.94■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa24.91■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa24.9■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rims2Q9EQZ7 1530 aa24.9■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Uspl1Q3ULM6 1089 aa24.89■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tsen2Q6P7W5 460 aa24.89■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 C5P06684 1680 aa24.88■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Als2Q920R0 1651 aa24.87■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Iqsec2Q5DU25 1478 aa24.86■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Erbb3Q61526 1339 aa24.86■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ralbp1Q62172 648 aa24.86■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttc41Q692V3 1318 aa24.85■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Abcc10Q8R4P9 1501 aa24.84■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf335A2A5K6 1337 aa24.84■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Med1Q925J9 1575 aa24.83■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mon2Q80TL7 1715 aa24.82■■□□□ 1.56
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc30Q8BVF4 654 aa24.81■■□□□ 1.56
Ldb1-201ENSMUST00000026252 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa24.81■■□□□ 1.56
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trim28Q62318 834 aa24.81■■□□□ 1.56
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