RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Txndc2Q6P902 515 aa25.43■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cnga1P29974 684 aa25.42■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa25.42■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif7B7ZNG0 1348 aa25.41■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Q7TT23 1179 aa25.4■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dip2bQ3UH60 1574 aa25.4■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa25.4■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dcaf11Q91VU6 549 aa25.4■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mink1Q9JM52 1308 aa25.37■■□□□ 1.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Abca14E9Q8F8 1683 aa25.37■■□□□ 1.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa25.33■■□□□ 1.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slit3Q9WVB4 1523 aa25.32■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Asxl2Q8BZ32 1370 aa25.32■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Csrnp3P59055 597 aa25.32■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 KdrP35918 1367 aa25.31■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ofd1Q80Z25 1017 aa25.31■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atf7ipQ7TT18 1306 aa25.31■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nwd1A6H603 1563 aa25.3■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gsto1O09131 240 aa25.29■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nrxn1Q9CS84 1514 aa25.28■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nlrp6Q91WS2 869 aa25.27■■□□□ 1.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cdk19Q8BWD8 501 aa25.26■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PzpQ61838 1495 aa25.26■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NktrP30415 1453 aa25.25■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa25.25■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bcl9Q9D219 1425 aa25.24■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 FanciQ8K368 1330 aa25.24■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa25.23■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cps1Q8C196 1500 aa25.23■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 IghaA0A0A6YXW6 389 aa25.2■■□□□ 1.63
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pik3r4Q8VD65 1358 aa25.2■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Adgrl1Q80TR1 1466 aa25.2■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zranb1Q7M760 708 aa25.17■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arap3Q8R5G7 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MyclP10166 368 aa25.16■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa25.14■■□□□ 1.62
Ldb1-201ENSMUST00000026252 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Esx1O88933 382 aa25.13■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp32F8VPZ3 1604 aa25.11■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Calr4Q3TQS0 420 aa25.09■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NinlQ6ZQ12 1394 aa25.09■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Alpk3Q924C5 1678 aa25.09■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Map3k19E9Q3S4 1311 aa25.08■■□□□ 1.61
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Topaz1E5FYH1 1653 aa25.08■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa25.05■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Idi2Q8BFZ6 227 aa25.04■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa25.04■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PtpruB1AUH1 1446 aa25.02■■□□□ 1.6
Ldb1-201ENSMUST00000026252 GsdmaQ9EST1 446 aa25.01■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Aplp2Q06335 707 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Golga2Q921M4 999 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif16bB1AVY7 1312 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sirt1Q923E4 737 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kank1E9Q238 1360 aa25■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Q3UJC8 639 aa24.99■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp19Q3UJD6 1360 aa24.99■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 L3mbtl2P59178 703 aa24.98■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CrbnQ8C7D2 445 aa24.98■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 P2rx7Q9Z1M0 595 aa24.98■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf316Q6PGE4 1016 aa24.97■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa24.96■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif1aP33173 1695 aa24.95■■□□□ 1.59
Ldb1-201ENSMUST00000026252 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CatipB9EKE5 520 aa24.94■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa24.91■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa24.9■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rims2Q9EQZ7 1530 aa24.9■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Uspl1Q3ULM6 1089 aa24.89■■□□□ 1.58
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tsen2Q6P7W5 460 aa24.89■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 C5P06684 1680 aa24.88■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Als2Q920R0 1651 aa24.87■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Iqsec2Q5DU25 1478 aa24.86■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Erbb3Q61526 1339 aa24.86■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ralbp1Q62172 648 aa24.86■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttc41Q692V3 1318 aa24.85■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Abcc10Q8R4P9 1501 aa24.84■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf335A2A5K6 1337 aa24.84■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Med1Q925J9 1575 aa24.83■■□□□ 1.57
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mon2Q80TL7 1715 aa24.82■■□□□ 1.56
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc30Q8BVF4 654 aa24.81■■□□□ 1.56
Ldb1-201ENSMUST00000026252 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa24.81■■□□□ 1.56
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trim28Q62318 834 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.7 ms