RNA–Protein interactions for RNA: YLR057W

MNL2, Transcript of Putative mannosidase involved in ER-associated protein degradation, yeast

Gene MNL2, Length 2,550 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MNL2	YLR057W	CYC2	P38909	366 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YGL204C	P53089	101 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	TVP18	Q04767	167 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	UBR1	P19812	1950 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	STP22	P25604	385 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	SRB6	P32570	121 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	SLM6	P38343	150 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	MOG1	P47123	218 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	SBH1	P52870	82 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	HHO1	P53551	258 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YOR093C	Q12275	1648 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	VTH1	P40438	1549 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	VTH2	P40890	1549 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	SPS2	P08459	502 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	SEC59	P20048	519 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	PEX34	P25584	144 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	FIG1	P38224	298 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	TRS20	P38334	175 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	GLC8	P41818	229 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YGR201C	P42936	225 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YDR366C	P87287	132 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	SAE3	P89114	91 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	UPS3	Q04006	179 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	RIM9	Q04734	239 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	UPS1	Q05776	175 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	RIB3	Q99258	208 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	MED11	Q99278	115 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	PET20	Q99373	253 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	USO1	P25386	1790 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YBT1	P32386	1661 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.97	□□□□□ -2.25	not detected
MNL2	YLR057W	IPT1	P38954	527 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	HPA3	P39979	161 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YGR017W	P53210	297 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	UBC7	Q02159	165 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	FRQ1	Q06389	190 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	BUD3	P25558	1636 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	HAP2	P06774	265 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	RPB7	P34087	171 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YNL019C	P53975	284 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	DYN2	Q02647	92 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YHP1	Q04116	353 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	NAT5	Q08689	176 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YLR046C	Q12253	270 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	SLO1	Q3E784	85 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	NUP192	P47054	1683 aa		0.96	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.25
MNL2	YLR057W	VMR1	P38735	1592 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	VMA21	P41806	77 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YFL065C	P43539	102 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YGL101W	P53144	215 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	VPS28	Q02767	242 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SWC7	Q06707	132 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	ATG10	Q07879	167 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	BCK1	Q01389	1478 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	COX5B	P00425	151 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	HAP3	P13434	144 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	ELP6	Q04868	273 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YOL131W	Q08270	108 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MHF1	Q3E835	90 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	ATP5	P09457	212 aa		0.95	□□□□□ -2.26

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