Protein–RNA interactions for Protein: P38182

ATG8, Autophagy-related protein 8, yeastyeast

RIP-Chip data

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG8P38182 NSR1YGR159C 1245 nt15.89■□□□□ 0.13
ATG8P38182 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.28■□□□□ 0.04
ATG8P38182 MDJ1YFL016C 1536 nt14.86□□□□□ -0.03
ATG8P38182 NOP1YDL014W 984 nt14.53□□□□□ -0.08
ATG8P38182 YJL027CYJL027C 417 nt13.62□□□□□ -0.23
ATG8P38182 SSA3YBL075C 1950 nt13.5□□□□□ -0.25
ATG8P38182 YBR190WYBR190W 312 nt12.88□□□□□ -0.35
ATG8P38182 DBP2YNL112W 1641 nt12.84□□□□□ -0.35
ATG8P38182 SRX1YKL086W 384 nt12.7□□□□□ -0.38
ATG8P38182 YKL036CYKL036C 393 nt12.67□□□□□ -0.38
ATG8P38182 RTC3YHR087W 336 nt12.53□□□□□ -0.4
ATG8P38182 Q0297Q0297 156 nt12.48□□□□□ -0.41
ATG8P38182 PUT4YOR348C 1884 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG8P38182 YCR051WYCR051W 669 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG8P38182 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG8P38182 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG8P38182 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG8P38182 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG8P38182 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG8P38182 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG8P38182 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG8P38182 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG8P38182 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG8P38182 RVS167YDR388W 1449 nt11.86□□□□□ -0.51
ATG8P38182 SPT5YML010W 3192 nt11.86□□□□□ -0.51
ATG8P38182 ARE1YCR048W 1833 nt11.86□□□□□ -0.51
ATG8P38182 POA1YBR022W 534 nt11.85□□□□□ -0.51
ATG8P38182 CCC1YLR220W 969 nt11.82□□□□□ -0.52
ATG8P38182 SSA4YER103W 1929 nt11.81□□□□□ -0.52
ATG8P38182 BSC6YOL137W 1494 nt11.76□□□□□ -0.53
ATG8P38182 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.69□□□□□ -0.54
ATG8P38182 SCJ1YMR214W 1134 nt11.66□□□□□ -0.54
ATG8P38182 SAH1YER043C 1350 nt11.58□□□□□ -0.56
ATG8P38182 BDF1YLR399C 2061 nt11.47□□□□□ -0.57
ATG8P38182 URN1YPR152C 1398 nt11.45□□□□□ -0.58
ATG8P38182 OPI9YLR338W 858 nt11.45□□□□□ -0.58
ATG8P38182 BUD23YCR047C 828 nt11.34□□□□□ -0.59
ATG8P38182 TAT1YBR069C 1860 nt11.29□□□□□ -0.6
ATG8P38182 SHR5YOL110W 714 nt11.27□□□□□ -0.61
ATG8P38182 PAC11YDR488C 1602 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG8P38182 DEP1YAL013W 1218 nt11.21□□□□□ -0.61
ATG8P38182 RPP1BYDL130W 321 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG8P38182 SCS3YGL126W 1143 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG8P38182 MEP2YNL142W 1500 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG8P38182 PTC2YER089C 1395 nt11.12□□□□□ -0.63
ATG8P38182 PUN1YLR414C 792 nt11.1□□□□□ -0.63
ATG8P38182 RPN10YHR200W 807 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG8P38182 NAB2YGL122C 1578 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG8P38182 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG8P38182 YOL085CYOL085C 342 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG8P38182 NVJ2YPR091C 2313 nt10.98□□□□□ -0.65
ATG8P38182 YNL208WYNL208W 600 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG8P38182 DCW1YKL046C 1350 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG8P38182 PKP1YIL042C 1185 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG8P38182 YJR018WYJR018W 363 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG8P38182 FIS1YIL065C 468 nt10.85□□□□□ -0.67
ATG8P38182 YBR220CYBR220C 1683 nt10.85□□□□□ -0.67
ATG8P38182 PET122YER153C 765 nt10.79□□□□□ -0.68
ATG8P38182 DAL1YIR027C 1383 nt10.77□□□□□ -0.68
ATG8P38182 YPS1YLR120C 1710 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG8P38182 EMI2YDR516C 1503 nt10.75□□□□□ -0.69
ATG8P38182 YMR090WYMR090W 684 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG8P38182 FPR4YLR449W 1179 nt10.72□□□□□ -0.69
ATG8P38182 YDJ1YNL064C 1230 nt10.7□□□□□ -0.7
ATG8P38182 PHO4YFR034C 939 nt10.68□□□□□ -0.7
ATG8P38182 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.68□□□□□ -0.7
ATG8P38182 PCH2YBR186W 1695 nt10.65□□□□□ -0.7
ATG8P38182 SDH1YKL148C 1923 nt10.64□□□□□ -0.71
ATG8P38182 GUT2YIL155C 1950 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG8P38182 YDL221WYDL221W 552 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG8P38182 INM2YDR287W 879 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG8P38182 GAR1YHR089C 618 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG8P38182 YDR095CYDR095C 411 nt10.57□□□□□ -0.72
ATG8P38182 SEC11YIR022W 504 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG8P38182 YJR120WYJR120W 351 nt10.55□□□□□ -0.72
ATG8P38182 CAC2YML102W 1407 nt10.49□□□□□ -0.73
ATG8P38182 PIB2YGL023C 1908 nt10.46□□□□□ -0.73
ATG8P38182 SCC4YER147C 1875 nt10.45□□□□□ -0.74
ATG8P38182 SCR1SCR1 522 nt10.44□□□□□ -0.74
ATG8P38182 RPP2BYDR382W 333 nt10.43□□□□□ -0.74
ATG8P38182 PTP1YDL230W 1008 nt10.42□□□□□ -0.74
ATG8P38182 RRN5YLR141W 1092 nt10.39□□□□□ -0.75
ATG8P38182 FPS1YLL043W 2010 nt10.39□□□□□ -0.75
ATG8P38182 YBL100CYBL100C 315 nt10.36□□□□□ -0.75
ATG8P38182 RPP2AYOL039W 321 nt10.36□□□□□ -0.75
ATG8P38182 IRC15YPL017C 1500 nt10.33□□□□□ -0.76
ATG8P38182 SSA1YAL005C 1929 nt10.31□□□□□ -0.76
ATG8P38182 YSC84YHR016C 1407 nt10.31□□□□□ -0.76
ATG8P38182 RTF1YGL244W 1677 nt10.31□□□□□ -0.76
ATG8P38182 GIS3YLR094C 1509 nt10.28□□□□□ -0.76
ATG8P38182 TIR1YER011W 765 nt10.26□□□□□ -0.77
ATG8P38182 YHL050CYHL050C 2094 nt10.24□□□□□ -0.77
ATG8P38182 ALF1YNL148C 765 nt10.22□□□□□ -0.77
ATG8P38182 FUN26YAL022C 1554 nt10.21□□□□□ -0.78
ATG8P38182 UME6YDR207C 2511 nt10.21□□□□□ -0.78
ATG8P38182 PTK1YKL198C 1989 nt10.18□□□□□ -0.78
ATG8P38182 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.18□□□□□ -0.78
ATG8P38182 BOP3YNL042W 1191 nt10.17□□□□□ -0.78
ATG8P38182 YJL225CYJL225C 5277 nt10.15□□□□□ -0.78
ATG8P38182 BOR1YNL275W 1731 nt10.15□□□□□ -0.78
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