RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C GPM1P00950 247 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C PRE9P23638 258 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C POP5P28005 173 aa5.22□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C NSA2P40078 261 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C MIC26P50087 233 aa5.22□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C FRQ1Q06389 190 aa5.22□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C URA5P13298 226 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C MST28P39552 234 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C BOL3P39724 118 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C CAF16P43569 289 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C CWC23P52868 283 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C RAI1P53063 387 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C MST27P53176 234 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C YGR018CP53211 109 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C OCA2P53949 197 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C VPS28Q02767 242 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C YLR224WQ05947 369 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C LDS2Q08218 356 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C MET32Q12041 191 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C AGC1Q12482 902 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C PRM4Q12498 284 aa5.21□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C NHP6BP11633 99 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C YCR022CP25620 114 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C FPR2P32472 135 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C AVT5P38176 459 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C CSH1P38287 376 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C WSS1P38838 269 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C SNF11P38956 169 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C BDH1P39714 382 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C RTS2P40962 232 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C GPG1P53130 126 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C DCS1Q06151 350 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C TRM13Q12383 476 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C RDI1Q12434 202 aa5.2□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C MRS3P10566 314 aa5.19□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C ERS1P17261 260 aa5.19□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C UTP11P34247 250 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C YKL162CP36052 402 aa5.19□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C SNU13P39990 126 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C HXT14P42833 540 aa5.19□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C HCH1P53834 153 aa5.19□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C TPI1P00942 248 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C ARG80P07249 177 aa5.18□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C YPC1P38298 316 aa5.18□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C ORM1P53224 222 aa5.18□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C YPL264CQ08980 353 aa5.18□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C RPN13O13563 156 aa5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C CYC7P00045 113 aa5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C SUA5P32579 426 aa5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C UPS2P35200 230 aa5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C MRPL3P36516 390 aa5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C GLE2P40066 365 aa5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C GPI2P46961 280 aa5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C IZH3Q07959 543 aa5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C PIS1P06197 220 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C PUT1P09368 476 aa5.16□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C SIP1P32578 815 aa5.16□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C YIF1P53845 314 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C SDH7Q04401 133 aa5.16□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C STP4Q07351 490 aa5.16□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C AIM45Q12480 344 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa5.16□□□□□ -1.58
SPE3YPR069C SPS2P08459 502 aa5.15□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YHR213WP0CI67 198 aa5.15□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C SEC22P22214 214 aa5.15□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C IMP2P46972 177 aa5.15□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C LST7P53237 242 aa5.15□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YOR011W-AQ3E807 68 aa5.15□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C CDC7P06243 507 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C TAL1P15019 335 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C FCY2P17064 533 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C CMC1P36064 111 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YIP3P53633 176 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C PDR17P53844 350 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YMR244WQ04018 355 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C POS5Q06892 414 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C ENV7Q12003 364 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YPL162CQ12042 273 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C COA2Q3E823 68 aa5.14□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C VMA22P38784 181 aa5.13□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C HST4P53688 370 aa5.13□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C MRPS8Q03799 155 aa5.13□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C SLM6P38343 150 aa5.12□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C RRF1P38771 230 aa5.12□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YIR035CP40579 254 aa5.12□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C LCB3P47013 409 aa5.12□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C RPA14P50106 137 aa5.12□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C VAM10Q08474 114 aa5.12□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C USV1Q12132 391 aa5.12□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C YPR063CQ12160 140 aa5.12□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C PRM7Q12459 698 aa5.12□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SPE3YPR069C ZRC1P20107 442 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms