RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	CAT5	P41735	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	CPD1	P53314	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	TRI1	Q05024	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	UBA3	Q99344	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	ARG80	P07249	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YNL194C	P40169	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YML018C	Q03730	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	ACB1	P31787	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	NRG2	P38082	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	LST8	P41318	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	AIM25	P47140	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	UBC12	P52491	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	GPG1	P53130	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YGR219W	P53307	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	VBA1	Q04301	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	IZH3	Q07959	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	QDR3	P38227	689 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	VPS63	O13549	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	PUT1	P09368	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	FMT1	P32785	401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	ELF1	P36053	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	MIC12	P38341	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YPI1	P43587	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	JAC1	P53193	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	MEH1	Q02205	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	HRD1	Q08109	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	FEX1	Q08913	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	RDI1	Q12434	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	POP2	P39008	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	DFG10	P40526	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	FSH2	Q05015	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	RRG8	Q06109	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	STP4	Q07351	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	PET20	Q99373	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	CNB1	P25296	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	TAD2	P47058	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	FEX2	Q08991	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	MRP17	P28778	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	SUA5	P32579	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	COS8	P38723	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	MST28	P39552	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	YAR068W	P39564	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	AGX1	P43567	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	MST27	P53176	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	YPR013C	Q12145	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	ATP16	Q12165	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	SEC22	P22214	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	POP8	P38208	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	SIM1	P40472	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	ALG13	P53178	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	GIM3	P53900	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	ANT1	Q06497	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	SCP1	Q08873	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	SWM2	P40342	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	RTT103	Q05543	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	SYM1	Q06563	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	AGC1	Q12482	902 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	MRS3	P10566	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	DOG2	P38773	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	DOG1	P38774	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	COX12	Q01519	83 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	ODC1	Q03028	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	THI74	Q04083	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	ATG39	Q06159	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	RAD28	Q12021	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	ATG5	Q12380	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	PRM4	Q12498	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.1 ms