Protein–RNA interactions for Protein: P41318

LST8, Target of rapamycin complex subunit LST8, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LST8P41318 NSR1YGR159C 1245 nt16.43■□□□□ 0.22
LST8P41318 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.36■□□□□ 0.21
LST8P41318 NOP1YDL014W 984 nt15.86■□□□□ 0.13
LST8P41318 MDJ1YFL016C 1536 nt14.75□□□□□ -0.05
LST8P41318 YKL036CYKL036C 393 nt14.44□□□□□ -0.1
LST8P41318 SRX1YKL086W 384 nt13.84□□□□□ -0.19
LST8P41318 Q0297Q0297 156 nt13.82□□□□□ -0.2
LST8P41318 YJL027CYJL027C 417 nt13.62□□□□□ -0.23
LST8P41318 YCR051WYCR051W 669 nt13.1□□□□□ -0.31
LST8P41318 SCS3YGL126W 1143 nt13.04□□□□□ -0.32
LST8P41318 DBP2YNL112W 1641 nt12.97□□□□□ -0.33
LST8P41318 YBR190WYBR190W 312 nt12.65□□□□□ -0.38
LST8P41318 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.63□□□□□ -0.39
LST8P41318 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.63□□□□□ -0.39
LST8P41318 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.63□□□□□ -0.39
LST8P41318 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.63□□□□□ -0.39
LST8P41318 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.63□□□□□ -0.39
LST8P41318 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.63□□□□□ -0.39
LST8P41318 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.63□□□□□ -0.39
LST8P41318 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.63□□□□□ -0.39
LST8P41318 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.63□□□□□ -0.39
LST8P41318 YOL085CYOL085C 342 nt12.51□□□□□ -0.41
LST8P41318 CCC1YLR220W 969 nt12.47□□□□□ -0.41
LST8P41318 RPP1BYDL130W 321 nt12.39□□□□□ -0.43
LST8P41318 RTC3YHR087W 336 nt12.34□□□□□ -0.43
LST8P41318 PKP1YIL042C 1185 nt12.32□□□□□ -0.44
LST8P41318 RVS167YDR388W 1449 nt12.19□□□□□ -0.46
LST8P41318 SCJ1YMR214W 1134 nt12.06□□□□□ -0.48
LST8P41318 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.88□□□□□ -0.51
LST8P41318 PET122YER153C 765 nt11.84□□□□□ -0.51
LST8P41318 SSA3YBL075C 1950 nt11.77□□□□□ -0.53
LST8P41318 SHR5YOL110W 714 nt11.71□□□□□ -0.53
LST8P41318 SCR1SCR1 522 nt11.69□□□□□ -0.54
LST8P41318 ATS1YAL020C 1002 nt11.62□□□□□ -0.55
LST8P41318 PUT4YOR348C 1884 nt11.6□□□□□ -0.55
LST8P41318 YDJ1YNL064C 1230 nt11.5□□□□□ -0.57
LST8P41318 RRN5YLR141W 1092 nt11.48□□□□□ -0.57
LST8P41318 URN1YPR152C 1398 nt11.48□□□□□ -0.57
LST8P41318 DEP1YAL013W 1218 nt11.41□□□□□ -0.58
LST8P41318 OPI9YLR338W 858 nt11.37□□□□□ -0.59
LST8P41318 ARE1YCR048W 1833 nt11.33□□□□□ -0.6
LST8P41318 SAH1YER043C 1350 nt11.31□□□□□ -0.6
LST8P41318 RPN10YHR200W 807 nt11.3□□□□□ -0.6
LST8P41318 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.26□□□□□ -0.61
LST8P41318 GAR1YHR089C 618 nt11.26□□□□□ -0.61
LST8P41318 YNL208WYNL208W 600 nt11.24□□□□□ -0.61
LST8P41318 POA1YBR022W 534 nt11.22□□□□□ -0.61
LST8P41318 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.2□□□□□ -0.62
LST8P41318 RSB1YOR049C 1065 nt11.2□□□□□ -0.62
LST8P41318 PUN1YLR414C 792 nt11.05□□□□□ -0.64
LST8P41318 BSC6YOL137W 1494 nt11.02□□□□□ -0.65
LST8P41318 YJR018WYJR018W 363 nt10.95□□□□□ -0.66
LST8P41318 PTC2YER089C 1395 nt10.92□□□□□ -0.66
LST8P41318 BUD23YCR047C 828 nt10.92□□□□□ -0.66
LST8P41318 TIR1YER011W 765 nt10.89□□□□□ -0.67
LST8P41318 NAB2YGL122C 1578 nt10.82□□□□□ -0.68
LST8P41318 PST2YDR032C 597 nt10.79□□□□□ -0.68
LST8P41318 SSA1YAL005C 1929 nt10.79□□□□□ -0.68
LST8P41318 YJR120WYJR120W 351 nt10.74□□□□□ -0.69
LST8P41318 RPP2BYDR382W 333 nt10.69□□□□□ -0.7
LST8P41318 FIS1YIL065C 468 nt10.65□□□□□ -0.7
LST8P41318 DAL1YIR027C 1383 nt10.65□□□□□ -0.71
LST8P41318 SPT5YML010W 3192 nt10.62□□□□□ -0.71
LST8P41318 INM2YDR287W 879 nt10.59□□□□□ -0.71
LST8P41318 FPR4YLR449W 1179 nt10.59□□□□□ -0.71
LST8P41318 SRB2YHR041C 633 nt10.56□□□□□ -0.72
LST8P41318 PHO4YFR034C 939 nt10.54□□□□□ -0.72
LST8P41318 YBL100CYBL100C 315 nt10.46□□□□□ -0.73
LST8P41318 BDH2YAL061W 1254 nt10.43□□□□□ -0.74
LST8P41318 SSA4YER103W 1929 nt10.42□□□□□ -0.74
LST8P41318 YPS1YLR120C 1710 nt10.39□□□□□ -0.75
LST8P41318 SHU1YHL006C 453 nt10.38□□□□□ -0.75
LST8P41318 WWM1YFL010C 636 nt10.37□□□□□ -0.75
LST8P41318 MEP2YNL142W 1500 nt10.37□□□□□ -0.75
LST8P41318 FUN26YAL022C 1554 nt10.32□□□□□ -0.76
LST8P41318 YDR095CYDR095C 411 nt10.31□□□□□ -0.76
LST8P41318 YGR021WYGR021W 873 nt10.29□□□□□ -0.76
LST8P41318 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.29□□□□□ -0.76
LST8P41318 LSM3YLR438C-A 270 nt10.28□□□□□ -0.76
LST8P41318 TRM9YML014W 840 nt10.27□□□□□ -0.77
LST8P41318 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.26□□□□□ -0.77
LST8P41318 YKL097CYKL097C 411 nt10.26□□□□□ -0.77
LST8P41318 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.24□□□□□ -0.77
LST8P41318 HOM6YJR139C 1080 nt10.23□□□□□ -0.77
LST8P41318 ALF1YNL148C 765 nt10.21□□□□□ -0.77
LST8P41318 CCT6YDR188W 1641 nt10.18□□□□□ -0.78
LST8P41318 DCW1YKL046C 1350 nt10.18□□□□□ -0.78
LST8P41318 MNP1YGL068W 585 nt10.14□□□□□ -0.79
LST8P41318 BDF1YLR399C 2061 nt10.13□□□□□ -0.79
LST8P41318 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.12□□□□□ -0.79
LST8P41318 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.12□□□□□ -0.79
LST8P41318 RPP2AYOL039W 321 nt10.11□□□□□ -0.79
LST8P41318 PTP1YDL230W 1008 nt10.08□□□□□ -0.8
LST8P41318 RKM5YLR137W 1104 nt10.08□□□□□ -0.8
LST8P41318 SIS1YNL007C 1059 nt10.07□□□□□ -0.8
LST8P41318 EMI2YDR516C 1503 nt10.07□□□□□ -0.8
LST8P41318 YMR090WYMR090W 684 nt10.03□□□□□ -0.8
LST8P41318 CAC2YML102W 1407 nt10.01□□□□□ -0.81
LST8P41318 YDL221WYDL221W 552 nt10□□□□□ -0.81
LST8P41318 TAT1YBR069C 1860 nt9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.7 ms