RNA–Protein interactions for RNA: YKL003C

MRP17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP17, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP17	YKL003C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	not detected
MRP17	YKL003C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	GET2	P40056	285 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YKE4	P40544	346 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YNG1	Q08465	219 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	RAD28	Q12021	506 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YCT1	Q12235	531 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	ATG31	Q12421	196 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	CYC3	P06182	269 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	NRG2	P38082	220 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	DOG2	P38773	246 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	DOG1	P38774	246 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	HCH1	P53834	153 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	USV1	Q12132	391 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	TRM13	Q12383	476 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	MRP17	P28778	131 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YKL162C	P36052	402 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	WSS1	P38838	269 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	GPG1	P53130	126 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	ATG39	Q06159	398 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	GEP3	Q08622	556 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	COA2	Q3E823	68 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	PUT1	P09368	476 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	MRPL3	P36516	390 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	CDS1	P38221	457 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	MST28	P39552	234 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	SIM1	P40472	476 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YPI1	P43587	155 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	MST27	P53176	234 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YGR018C	P53211	109 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YPS3	Q12303	508 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	COX2	P00410	251 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	ARG80	P07249	177 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YCR022C	P25620	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	SUA5	P32579	426 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	SRL3	P36167	246 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YBL071C	P38185	102 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YBR242W	P38331	238 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	GLE2	P40066	365 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YIR035C	P40579	254 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YGR025W	P53216	100 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	TIM18	Q08749	192 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	POP5	P28005	173 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	RRT1	P38192	103 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	BDH1	P39714	382 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	HXT14	P42833	540 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	AGX1	P43567	385 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	TRI1	Q05024	226 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	POS5	Q06892	414 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	RRT7	Q07829	113 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	AGC1	Q12482	902 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MRP17	YKL003C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	FCY2	P17064	533 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	SEC22	P22214	214 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	CSH1	P38287	376 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YPC1	P38298	316 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	POR2	P40478	281 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	TDA4	P47153	279 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	MIC26	P50087	233 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YAP1802	P53309	568 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	OCA2	P53949	197 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	DCS1	Q06151	350 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YCR025C	P25352	136 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	AVT5	P38176	459 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	POM34	Q12445	299 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	SIP1	P32578	815 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	PPQ1	P32945	549 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YEA6	P39953	335 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	RTS2	P40962	232 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	CAF16	P43569	289 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	IMP2	P46972	177 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	LCB3	P47013	409 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	ALG13	P53178	202 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	LST7	P53237	242 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	PDR17	P53844	350 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	FYV6	P53913	173 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	GPI15	P53961	229 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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