RNA–Protein interactions for RNA: YDR057W

YOS9, Transcript of ER quality-control lectin, yeast

Gene YOS9, Length 1,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOS9	YDR057W	AQY1	P0CD91	305 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YBR063C	P38083	404 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YHR140W	P38842	239 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YNL195C	P40168	261 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YFL065C	P43539	102 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	ATG18	P43601	500 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	GEP7	P53171	287 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	LOA1	Q06508	300 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YPR203W	Q08994	102 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YPL162C	Q12042	273 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YPR064W	Q12492	139 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	MRS3	P10566	314 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	ATG12	P38316	186 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	SWS2	P53937	143 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	POP8	P38208	133 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YAR029W	P39549	74 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	GAS3	Q03655	524 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YOS9	YDR057W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	KOG1	P38873	1557 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	APS1	P35181	156 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	CAT5	P41735	233 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	UBC13	P52490	153 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YPL039W	Q03080	316 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	FIT3	Q08907	204 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	5.77	□□□□□ -1.49	not detected
YOS9	YDR057W	EAF3	Q12432	401 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	VMA11	P32842	164 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	AVT7	P40501	490 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	SYS1	P41544	203 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	KEG1	P43614	200 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	GPI2	P46961	280 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	FHN1	P53279	174 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	SPR6	Q01684	191 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YDL180W	Q12301	547 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	ATG2	P53855	1592 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	FIP1	P45976	327 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	PGA1	P53896	198 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	NUP100	Q02629	959 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YLR012C	Q07927	99 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YOL159C	Q08300	171 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	ECM12	O13529	151 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	MIG1	P27705	504 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
YOS9	YDR057W	ARN2	P38724	620 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	CUP9	P41817	306 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YPS5	P53057	165 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	NCE103	P53615	221 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YMR082C	Q04276	118 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	SPG4	Q04438	115 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	BUD25	P85052	153 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	FIT1	Q04433	528 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	HRT1	Q08273	121 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	SLM3	Q12093	417 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YGL010W	P25338	174 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.73	□□□□□ -1.49	not detected
YOS9	YDR057W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	MRP21	P38175	177 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	CSH1	P38287	376 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YER181C	P40097	107 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	CWP2	P43497	92 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	EAF6	P47128	113 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	VHT1	P53241	593 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	RNH201	P53942	307 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	CYT2	Q00873	224 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	PAU23	Q07987	124 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	NAT5	Q08689	176 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YLR122C	Q12312	125 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	PAU17	Q12370	124 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	TSC3	Q3E790	80 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YPL229W	Q99395	206 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	YSC84	P32793	468 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YOS9	YDR057W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49

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