Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 NSR1YGR159C 1245 nt15.33■□□□□ 0.04
YHR140WP38842 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.02■□□□□ -0
YHR140WP38842 NOP1YDL014W 984 nt14.51□□□□□ -0.09
YHR140WP38842 MDJ1YFL016C 1536 nt13.9□□□□□ -0.19
YHR140WP38842 YKL036CYKL036C 393 nt12.98□□□□□ -0.33
YHR140WP38842 YJL027CYJL027C 417 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR140WP38842 SRX1YKL086W 384 nt12.64□□□□□ -0.39
YHR140WP38842 Q0297Q0297 156 nt12.55□□□□□ -0.4
YHR140WP38842 DBP2YNL112W 1641 nt12.14□□□□□ -0.47
YHR140WP38842 YBR190WYBR190W 312 nt12.03□□□□□ -0.48
YHR140WP38842 YCR051WYCR051W 669 nt11.95□□□□□ -0.5
YHR140WP38842 RTC3YHR087W 336 nt11.72□□□□□ -0.53
YHR140WP38842 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 SSA3YBL075C 1950 nt11.61□□□□□ -0.55
YHR140WP38842 SCS3YGL126W 1143 nt11.56□□□□□ -0.56
YHR140WP38842 CCC1YLR220W 969 nt11.5□□□□□ -0.57
YHR140WP38842 RVS167YDR388W 1449 nt11.41□□□□□ -0.58
YHR140WP38842 RPP1BYDL130W 321 nt11.25□□□□□ -0.61
YHR140WP38842 YOL085CYOL085C 342 nt11.23□□□□□ -0.61
YHR140WP38842 PUT4YOR348C 1884 nt11.18□□□□□ -0.62
YHR140WP38842 SCJ1YMR214W 1134 nt11.16□□□□□ -0.62
YHR140WP38842 PKP1YIL042C 1185 nt11.06□□□□□ -0.64
YHR140WP38842 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.89□□□□□ -0.67
YHR140WP38842 SHR5YOL110W 714 nt10.89□□□□□ -0.67
YHR140WP38842 ARE1YCR048W 1833 nt10.84□□□□□ -0.67
YHR140WP38842 URN1YPR152C 1398 nt10.81□□□□□ -0.68
YHR140WP38842 POA1YBR022W 534 nt10.8□□□□□ -0.68
YHR140WP38842 OPI9YLR338W 858 nt10.76□□□□□ -0.69
YHR140WP38842 PET122YER153C 765 nt10.75□□□□□ -0.69
YHR140WP38842 SAH1YER043C 1350 nt10.75□□□□□ -0.69
YHR140WP38842 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.71□□□□□ -0.69
YHR140WP38842 DEP1YAL013W 1218 nt10.65□□□□□ -0.7
YHR140WP38842 BSC6YOL137W 1494 nt10.63□□□□□ -0.71
YHR140WP38842 RPN10YHR200W 807 nt10.63□□□□□ -0.71
YHR140WP38842 SCR1SCR1 522 nt10.6□□□□□ -0.71
YHR140WP38842 YDJ1YNL064C 1230 nt10.57□□□□□ -0.72
YHR140WP38842 YNL208WYNL208W 600 nt10.51□□□□□ -0.73
YHR140WP38842 PUN1YLR414C 792 nt10.46□□□□□ -0.73
YHR140WP38842 BUD23YCR047C 828 nt10.44□□□□□ -0.74
YHR140WP38842 RRN5YLR141W 1092 nt10.42□□□□□ -0.74
YHR140WP38842 SPT5YML010W 3192 nt10.41□□□□□ -0.74
YHR140WP38842 PTC2YER089C 1395 nt10.36□□□□□ -0.75
YHR140WP38842 GAR1YHR089C 618 nt10.35□□□□□ -0.75
YHR140WP38842 NAB2YGL122C 1578 nt10.31□□□□□ -0.76
YHR140WP38842 YJR018WYJR018W 363 nt10.31□□□□□ -0.76
YHR140WP38842 SSA4YER103W 1929 nt10.25□□□□□ -0.77
YHR140WP38842 ATS1YAL020C 1002 nt10.25□□□□□ -0.77
YHR140WP38842 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.2□□□□□ -0.78
YHR140WP38842 RSB1YOR049C 1065 nt10.09□□□□□ -0.79
YHR140WP38842 DAL1YIR027C 1383 nt10.09□□□□□ -0.79
YHR140WP38842 FIS1YIL065C 468 nt10.07□□□□□ -0.8
YHR140WP38842 MEP2YNL142W 1500 nt10.05□□□□□ -0.8
YHR140WP38842 TIR1YER011W 765 nt10.04□□□□□ -0.8
YHR140WP38842 INM2YDR287W 879 nt10.03□□□□□ -0.8
YHR140WP38842 RPP2BYDR382W 333 nt10.03□□□□□ -0.8
YHR140WP38842 FPR4YLR449W 1179 nt10.03□□□□□ -0.8
YHR140WP38842 YJR120WYJR120W 351 nt9.99□□□□□ -0.81
YHR140WP38842 PHO4YFR034C 939 nt9.97□□□□□ -0.81
YHR140WP38842 SSA1YAL005C 1929 nt9.96□□□□□ -0.81
YHR140WP38842 YPS1YLR120C 1710 nt9.93□□□□□ -0.82
YHR140WP38842 BDF1YLR399C 2061 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR140WP38842 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.85□□□□□ -0.83
YHR140WP38842 DCW1YKL046C 1350 nt9.83□□□□□ -0.84
YHR140WP38842 YBL100CYBL100C 315 nt9.82□□□□□ -0.84
YHR140WP38842 YDR095CYDR095C 411 nt9.81□□□□□ -0.84
YHR140WP38842 YMR090WYMR090W 684 nt9.78□□□□□ -0.84
YHR140WP38842 PAC11YDR488C 1602 nt9.78□□□□□ -0.84
YHR140WP38842 TAT1YBR069C 1860 nt9.76□□□□□ -0.85
YHR140WP38842 EMI2YDR516C 1503 nt9.74□□□□□ -0.85
YHR140WP38842 BDH2YAL061W 1254 nt9.74□□□□□ -0.85
YHR140WP38842 FUN26YAL022C 1554 nt9.69□□□□□ -0.86
YHR140WP38842 YBR220CYBR220C 1683 nt9.67□□□□□ -0.86
YHR140WP38842 ALF1YNL148C 765 nt9.66□□□□□ -0.86
YHR140WP38842 SRB2YHR041C 633 nt9.65□□□□□ -0.86
YHR140WP38842 NVJ2YPR091C 2313 nt9.64□□□□□ -0.87
YHR140WP38842 YDL221WYDL221W 552 nt9.64□□□□□ -0.87
YHR140WP38842 TRM9YML014W 840 nt9.64□□□□□ -0.87
YHR140WP38842 RPP2AYOL039W 321 nt9.64□□□□□ -0.87
YHR140WP38842 SDH1YKL148C 1923 nt9.59□□□□□ -0.87
YHR140WP38842 PTP1YDL230W 1008 nt9.59□□□□□ -0.87
YHR140WP38842 CAC2YML102W 1407 nt9.57□□□□□ -0.88
YHR140WP38842 FPS1YLL043W 2010 nt9.57□□□□□ -0.88
YHR140WP38842 PST2YDR032C 597 nt9.56□□□□□ -0.88
YHR140WP38842 LSM3YLR438C-A 270 nt9.56□□□□□ -0.88
YHR140WP38842 YJL225CYJL225C 5277 nt9.56□□□□□ -0.88
YHR140WP38842 CCT6YDR188W 1641 nt9.54□□□□□ -0.88
YHR140WP38842 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.53□□□□□ -0.88
YHR140WP38842 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.53□□□□□ -0.88
YHR140WP38842 SIS1YNL007C 1059 nt9.51□□□□□ -0.89
YHR140WP38842 WWM1YFL010C 636 nt9.5□□□□□ -0.89
YHR140WP38842 SCC4YER147C 1875 nt9.48□□□□□ -0.89
YHR140WP38842 SEC11YIR022W 504 nt9.46□□□□□ -0.9
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