RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M ERV29P53337 310 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M CPR8P53728 308 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TMA20P89886 181 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL13Q02204 264 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M CAB5Q03941 241 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR130WQ04223 302 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR286CQ05530 114 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR281CQ05863 155 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M KEI1Q06346 221 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MED4Q12343 284 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M UBA3Q99344 299 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M URA5P13298 226 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MSN1P22148 382 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ERV1P27882 189 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MRP20P32387 263 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M VMA8P32610 256 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RIB7P33312 244 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M PAN3P36102 679 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ATP3P38077 311 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M NRG2P38082 220 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M LSM12P38828 187 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR122WP38829 231 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M POP2P39008 433 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M JLP2P40206 208 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M LST8P41318 303 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M SER2P42941 309 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RPA34P47006 233 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC18P47056 224 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM25P47140 327 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M CAX4P53223 239 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL22P53881 309 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GIM3P53900 129 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ACT1P60010 375 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GRX3Q03835 250 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YHP1Q04116 353 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M VBA1Q04301 562 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M FSH2Q05015 223 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR215CQ12240 137 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG5Q12380 294 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HBN1Q96VH4 193 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS63O13549 108 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TRP4P07285 380 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M CHO1P08456 276 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR31P19955 123 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YCP4P25349 247 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M AUA1P32450 94 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MSS1P32559 526 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M POP8P38208 133 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M QDR3P38227 689 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR184WP38299 523 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M FLO5P38894 1075 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data2.03□□□□□ -2.08not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M MST28P39552 234 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M SNU13P39990 126 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RFC2P40348 353 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M BNA6P43619 295 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL163CP46996 555 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR012CP47087 207 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ARP3P47117 449 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM27P47144 725 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M DIE2P50076 525 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MST27P53176 234 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ERV25P54837 211 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TY1A-MR1Q04215 440 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RTT103Q05543 409 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TDA6Q06466 467 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HRD1Q08109 551 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GEP3Q08622 556 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M SCP1Q08873 200 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M FEX1Q08913 375 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M FEX2Q08991 375 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MSH5Q12175 901 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RDI1Q12434 202 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M PET20Q99373 253 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN13O13563 156 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M PET494P07390 489 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M GRX2P17695 143 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M HYM1P32464 399 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SPS18P32572 300 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M FMT1P32785 401 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M PDC2P32896 925 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP23P38231 175 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M MED8P38304 223 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YER137CP40083 148 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SIM1P40472 476 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M PRM5P40476 318 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M DFG10P40526 253 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M CWC23P52868 283 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M RAI1P53063 387 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SWT21P53873 357 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M DYN2Q02647 92 aa2.02□□□□□ -2.09
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