RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K ERV29P53337 310 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CPR8P53728 308 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TMA20P89886 181 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL13Q02204 264 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CAB5Q03941 241 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR130WQ04223 302 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR286CQ05530 114 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR281CQ05863 155 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K KEI1Q06346 221 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MED4Q12343 284 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K UBA3Q99344 299 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K URA5P13298 226 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MSN1P22148 382 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ERV1P27882 189 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MRP20P32387 263 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K VMA8P32610 256 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RIB7P33312 244 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PAN3P36102 679 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ATP3P38077 311 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K NRG2P38082 220 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K LSM12P38828 187 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR122WP38829 231 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K POP2P39008 433 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K JLP2P40206 208 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K LST8P41318 303 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K SER2P42941 309 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RPA34P47006 233 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K IRC18P47056 224 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM25P47140 327 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CAX4P53223 239 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL22P53881 309 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GIM3P53900 129 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ACT1P60010 375 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GRX3Q03835 250 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YHP1Q04116 353 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K VBA1Q04301 562 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K FSH2Q05015 223 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR215CQ12240 137 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG5Q12380 294 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HBN1Q96VH4 193 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS63O13549 108 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TRP4P07285 380 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CHO1P08456 276 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR31P19955 123 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YCP4P25349 247 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K AUA1P32450 94 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MSS1P32559 526 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K POP8P38208 133 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K QDR3P38227 689 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR184WP38299 523 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K FLO5P38894 1075 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data2.03□□□□□ -2.08not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K MST28P39552 234 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K SNU13P39990 126 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RFC2P40348 353 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K BNA6P43619 295 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL163CP46996 555 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR012CP47087 207 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ARP3P47117 449 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM27P47144 725 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K DIE2P50076 525 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MST27P53176 234 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ERV25P54837 211 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TY1A-MR1Q04215 440 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RTT103Q05543 409 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TDA6Q06466 467 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HRD1Q08109 551 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GEP3Q08622 556 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K SCP1Q08873 200 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K FEX1Q08913 375 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K FEX2Q08991 375 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MSH5Q12175 901 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RDI1Q12434 202 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PET20Q99373 253 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RPN13O13563 156 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K PET494P07390 489 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K GRX2P17695 143 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K HYM1P32464 399 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SPS18P32572 300 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K FMT1P32785 401 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K PDC2P32896 925 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K FMP23P38231 175 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K MED8P38304 223 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YER137CP40083 148 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SIM1P40472 476 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K PRM5P40476 318 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K DFG10P40526 253 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K CWC23P52868 283 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K RAI1P53063 387 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SWT21P53873 357 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K DYN2Q02647 92 aa2.02□□□□□ -2.09
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