RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)G2

tW(CCA)G2, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)G2, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ERV29P53337 310 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CPR8P53728 308 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TMA20P89886 181 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRPL13Q02204 264 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CAB5Q03941 241 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YMR130WQ04223 302 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YDR286CQ05530 114 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YLR281CQ05863 155 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 KEI1Q06346 221 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MED4Q12343 284 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UBA3Q99344 299 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 URA5P13298 226 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MSN1P22148 382 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ERV1P27882 189 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRP20P32387 263 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VMA8P32610 256 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RIB7P33312 244 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PAN3P36102 679 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ATP3P38077 311 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NRG2P38082 220 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LSM12P38828 187 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YHR122WP38829 231 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 POP2P39008 433 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 JLP2P40206 208 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LST8P41318 303 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SER2P42941 309 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPA34P47006 233 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IRC18P47056 224 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIM25P47140 327 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CAX4P53223 239 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRPL22P53881 309 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GIM3P53900 129 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ACT1P60010 375 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GRX3Q03835 250 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YHP1Q04116 353 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VBA1Q04301 562 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FSH2Q05015 223 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YDR215CQ12240 137 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ATG5Q12380 294 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HBN1Q96VH4 193 aa2.04□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VPS63O13549 108 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TRP4P07285 380 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CHO1P08456 276 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YMR31P19955 123 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YCP4P25349 247 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AUA1P32450 94 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MSS1P32559 526 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 POP8P38208 133 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 QDR3P38227 689 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YBR184WP38299 523 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FLO5P38894 1075 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data2.03□□□□□ -2.08not detected
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MST28P39552 234 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SNU13P39990 126 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RFC2P40348 353 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BNA6P43619 295 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YJL163CP46996 555 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YJR012CP47087 207 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ARP3P47117 449 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ECM27P47144 725 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DIE2P50076 525 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MST27P53176 234 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ERV25P54837 211 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TY1A-MR1Q04215 440 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RTT103Q05543 409 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TDA6Q06466 467 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HRD1Q08109 551 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GEP3Q08622 556 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SCP1Q08873 200 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FEX1Q08913 375 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FEX2Q08991 375 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MSH5Q12175 901 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RDI1Q12434 202 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PET20Q99373 253 aa2.03□□□□□ -2.08
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPN13O13563 156 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PET494P07390 489 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GRX2P17695 143 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HYM1P32464 399 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPS18P32572 300 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FMT1P32785 401 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PDC2P32896 925 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FMP23P38231 175 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MED8P38304 223 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YER137CP40083 148 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SIM1P40472 476 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PRM5P40476 318 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DFG10P40526 253 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CWC23P52868 283 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RAI1P53063 387 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SWT21P53873 357 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DYN2Q02647 92 aa2.02□□□□□ -2.09
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