RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W KCC4P25389 1037 aa11.96□□□□□ -0.49
PRP4YPR178W SWC3P31376 625 aa11.96□□□□□ -0.49
PRP4YPR178W AIM9P40053 627 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PRP4YPR178W CEP3P40969 608 aa11.96□□□□□ -0.49
PRP4YPR178W NCB2Q92317 146 aa11.96□□□□□ -0.49
PRP4YPR178W LTV1P34078 463 aa11.95□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W PRX1P34227 261 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W AAP1P37898 856 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W NPR3P38742 1146 aa11.95□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W TIM50Q02776 476 aa11.95□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W SFI1Q12369 946 aa11.94□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W TPM1P17536 199 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W TTI1P36097 1038 aa11.93□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W PDR18P53756 1333 aa11.92□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W CIN4P39110 191 aa11.92□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W SPO22P40511 975 aa11.92□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W SMC3P47037 1230 aa11.92□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W RMD1Q03441 430 aa11.92□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W FRS2P15625 503 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W ATE1P16639 503 aa11.91□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W SSL2Q00578 843 aa11.91□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W SES1P07284 462 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W MBR1P23493 339 aa11.9□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W MFT1P33441 392 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W DNM1P54861 757 aa11.9□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W TRS33Q99394 268 aa11.9□□□□□ -0.5
PRP4YPR178W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W RAD26P40352 1085 aa11.89□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W CST6P40535 587 aa11.89□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W CTF18P49956 741 aa11.89□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W NUP133P36161 1157 aa11.88□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W MLC1P53141 149 aa11.88□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W MRPS35P53292 345 aa11.88□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W VPS60Q03390 229 aa11.88□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W SGD1Q06132 899 aa11.88□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W PSK2Q08217 1101 aa11.87□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W MNR2P35724 969 aa11.86□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W YPL150WQ12152 901 aa11.86□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W YJR008WP47085 338 aa11.85□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W YGL242CP53066 181 aa11.85□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W ELG1Q12050 791 aa11.85□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W UBP12P39538 1254 aa11.84□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W SLM3Q12093 417 aa11.84□□□□□ -0.51
PRP4YPR178W KTR1P27810 393 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W ZDS2P54786 942 aa11.83□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W SWI1P09547 1314 aa11.82□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W RDS1P25611 832 aa11.82□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W ALO1P54783 526 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W YHL017WP38745 532 aa11.81□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W ARP5P53946 755 aa11.81□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W PET111P08468 800 aa11.8□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W GPA1P08539 472 aa11.8□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W MRC1P25588 1096 aa11.8□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W RCR1P38212 213 aa11.8□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W RRM3P38766 723 aa11.8□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data11.8□□□□□ -0.52not detected
PRP4YPR178W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W LPD1P09624 499 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W SPC110P32380 944 aa11.79□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W MAL33P38157 468 aa11.79□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W STM1P39015 273 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W YPT11P48559 417 aa11.79□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W INP54Q08227 384 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W ALE1Q08548 619 aa11.79□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W YIL177CP40434 1758 aa11.78□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W YJL225CP40889 1758 aa11.78□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W MIF2P35201 549 aa11.78□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W ENT3P47160 408 aa11.78□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W MEC3Q02574 474 aa11.78□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W YMR196WQ04336 1088 aa11.78□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W MSB4Q12317 492 aa11.78□□□□□ -0.52
PRP4YPR178W TY4B-HP0C2J7 1802 aa11.77□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W TY4B-JP47024 1803 aa11.77□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W DEP1P31385 405 aa11.77□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W YER130CP39959 443 aa11.77□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W BBC1P47068 1157 aa11.77□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W CTH1P47976 325 aa11.77□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W VID28P40547 921 aa11.76□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W XKS1P42826 600 aa11.76□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W COG4Q06096 861 aa11.76□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W MATALPHA2P0CY08 210 aa11.75□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W HMLALPHA2P0CY09 210 aa11.75□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W SET1P38827 1080 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W YKE2P52553 114 aa11.75□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W GSY2P27472 705 aa11.74□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W RFC5P38251 354 aa11.74□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PRP4YPR178W FKS3Q04952 1785 aa11.74□□□□□ -0.53
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