RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A UBP15P50101 1230 aa1.69□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A PDI1P17967 522 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A RSC6P25632 483 aa1.69□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A VAN1P23642 535 aa1.68□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A SBE2P42223 864 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A CUZ1P53899 274 aa1.68□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A YPR148CQ06523 435 aa1.68□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A NHA1Q99271 985 aa1.68□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A DSF2P38213 736 aa1.67□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A PRY1P47032 299 aa1.67□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A VAC17P25591 423 aa1.67□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A TOS1P38288 455 aa1.67□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A NEO1P40527 1151 aa1.67□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A MRX12P47084 519 aa1.67□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data1.67□□□□□ -2.14not detected
YPL060C-AYPL060C-A YBL086CP38177 466 aa1.66□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A YDL176WQ12027 708 aa1.66□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A MRT4P33201 236 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A ISU1Q03020 165 aa1.66□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A MOD5P07884 428 aa1.66□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A GAP1P19145 602 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A EMW1P42842 904 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A MCM16Q12262 181 aa1.65□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A DIT1P21623 536 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A KAE1P36132 386 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A RPN1P38764 993 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A LSB6P42951 607 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A AVT1P47082 602 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A YGR130CP53278 816 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A CYT1P07143 309 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A SPT5P27692 1063 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A TPD3P31383 635 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A RTG2P32608 588 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A JJJ3P47138 172 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A TRS33Q99394 268 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A Q0182Q9ZZW1 134 aa1.65□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A SIT4P20604 311 aa1.64□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A CDC19P00549 500 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A SAC7P17121 654 aa1.64□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A IRE1P32361 1115 aa1.64□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A NTH2P35172 780 aa1.64□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A RRM3P38766 723 aa1.64□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A SOK2P53438 785 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A AGE1Q04412 482 aa1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A RSC2Q06488 889 aa1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A AIM9P40053 627 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A CCT8P47079 568 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A NAF1P53919 492 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A AVO1Q08236 1176 aa1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A MED7Q08278 222 aa1.63□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A HDA3Q06623 655 aa1.62□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A CHS2P14180 963 aa1.62□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A POL12P38121 705 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A NUP42P49686 430 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A YPL034WQ03083 165 aa1.61□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A MCA1Q08601 432 aa1.61□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data1.61□□□□□ -2.15not detected
YPL060C-AYPL060C-A UBX7P38349 436 aa1.61□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A PUN1Q06991 263 aa1.61□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A MAK16P10962 306 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A SUT1P53032 299 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A RSB1Q08417 382 aa1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A CYC7P00045 113 aa1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A CSE4P36012 229 aa1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A LDH1P38139 375 aa1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A SUM1P46676 1062 aa1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A AIM7Q12156 149 aa1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A TPS3P38426 1054 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A TED1P40533 473 aa1.6□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A PGM2P37012 569 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
YPL060C-AYPL060C-A YDJ1P25491 409 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A MCX1P38323 520 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A YLL054CQ12244 843 aa1.59□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A GPM1P00950 247 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A RRN6P32786 894 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A JJJ2P46997 583 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A STE6P12866 1290 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A THI12P42883 340 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A THI5P43534 340 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A THI11P47183 340 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A FAR11P53917 953 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A ECM23Q02710 187 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A THI13Q07748 340 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A YDR461C-AQ2V2P7 80 aa1.58□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A MAE1P36013 669 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A SWI5P08153 709 aa1.57□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A NAM8Q00539 523 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A HEH2Q03281 663 aa1.57□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A SYT1Q06836 1226 aa1.57□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A HAP4P14064 554 aa1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A AMN1P38285 549 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A MSN5P52918 1224 aa1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A PPT1P53043 513 aa1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A PDC5P16467 563 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A PDC6P26263 563 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
YPL060C-AYPL060C-A DAL1P32375 460 aa1.56□□□□□ -2.16
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