RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165953.2

Nelfe-202, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Myo3aQ8K3H5 1613 aa34.26■■■■□ 3.08
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Setd1aE9PYH6 1716 aa34.26■■■■□ 3.07
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 PplQ9R269 1755 aa34.2■■■■□ 3.07
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa34.18■■■■□ 3.06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 ErbinQ80TH2 1402 aa34.17■■■■□ 3.06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 IghaA0A0A6YXW6 389 aa34.14■■■■□ 3.06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PalldQ9ET54 1408 aa34.13■■■■□ 3.05
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sall3Q62255 1320 aa34.13■■■■□ 3.05
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mroh1E0CZ22 1640 aa34.12■■■■□ 3.05
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa34.12■■■■□ 3.05
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa34.1■■■■□ 3.05
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Abca8aQ8K442 1620 aa34.09■■■■□ 3.05
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pik3c2gO70167 1506 aa34.08■■■■□ 3.05
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Asxl2Q8BZ32 1370 aa34.03■■■■□ 3.04
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mphosph9A6H5Y1 991 aa34.03■■■■□ 3.04
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Amigo3Q8C2S7 508 aa34.03■■■■□ 3.04
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arhgef28P97433 1693 aa34.01■■■■□ 3.03
Nelfe-202ENSMUST00000165953 AatkQ80YE4 1365 aa34.01■■■■□ 3.03
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Atp1b4Q99ME6 356 aa33.99■■■■□ 3.03
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slit3Q9WVB4 1523 aa33.97■■■■□ 3.03
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Col18a1P39061 1774 aa33.96■■■■□ 3.03
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mbd5B1AYB6 1498 aa33.95■■■■□ 3.02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif21bQ9QXL1 1668 aa33.94■■■■□ 3.02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 DnmbpQ6TXD4 1580 aa33.93■■■■□ 3.02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa33.93■■■■□ 3.02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tns3Q5SSZ5 1440 aa33.9■■■■□ 3.02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Brinp3Q499E0 766 aa33.88■■■■□ 3.01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 GapdhsQ64467 440 aa33.88■■■■□ 3.01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Evi5lH3BKQ3 813 aa33.86■■■■□ 3.01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa33.86■■■■□ 3.01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tom1O88746 492 aa33.85■■■■□ 3.01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 AU022751B1B0V2 589 aa33.85■■■■□ 3.01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Q9D9H8 365 aa33.84■■■■□ 3.01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slain2Q8CI08 581 aa33.83■■■■□ 3.01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pkd2O35245 966 aa33.82■■■■□ 3
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gimap5Q8BWF2 308 aa33.77■■■■□ 3
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa33.74■■■□□ 2.99
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dot1lQ6XZL8 1540 aa33.73■■■□□ 2.99
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pik3r4Q8VD65 1358 aa33.73■■■□□ 2.99
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa33.73■■■□□ 2.99
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arap3Q8R5G7 1538 aa33.72■■■□□ 2.99
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pik3c2aQ61194 1686 aa33.7■■■□□ 2.99
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccer2J3QPU5 274 aa33.7■■■□□ 2.98
Nelfe-202ENSMUST00000165953 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tmem94Q7TSH8 1360 aa33.67■■■□□ 2.98
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa33.66■■■□□ 2.98
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa33.66■■■□□ 2.98
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ttll13A4Q9F6 804 aa33.6■■■□□ 2.97
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Atf3Q60765 181 aa33.6■■■□□ 2.97
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Washc2Q6PGL7 1334 aa33.59■■■□□ 2.97
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Col14a1Q80X19 1797 aa33.59■■■□□ 2.97
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nwd1A6H603 1563 aa33.58■■■□□ 2.97
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ift172Q6VH22 1749 aa33.55■■■□□ 2.96
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fbln2P37889 1221 aa33.54■■■□□ 2.96
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nyap1Q6PFX7 833 aa33.54■■■□□ 2.96
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa33.52■■■□□ 2.96
Nelfe-202ENSMUST00000165953 MaddQ80U28 1577 aa33.52■■■□□ 2.96
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rims1Q99NE5 1463 aa33.51■■■□□ 2.96
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cps1Q8C196 1500 aa33.49■■■□□ 2.95
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NalcnQ8BXR5 1738 aa33.48■■■□□ 2.95
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rock1P70335 1354 aa33.47■■■□□ 2.95
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dapk1Q80YE7 1442 aa33.47■■■□□ 2.95
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Qtrt2B8ZXI1 415 aa33.47■■■□□ 2.95
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tulp4Q9JIL5 1547 aa33.46■■■□□ 2.95
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Stk26Q99JT2 416 aa33.45■■■□□ 2.94
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc52a2Q9D8F3 450 aa33.43■■■□□ 2.94
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kdm2aP59997 1161 aa33.41■■■□□ 2.94
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rgl3Q3UYI5 709 aa33.39■■■□□ 2.94
Nelfe-202ENSMUST00000165953 C3P01027 1663 aa33.39■■■□□ 2.94
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa33.37■■■□□ 2.93
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa33.35■■■□□ 2.93
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fan1Q69ZT1 1020 aa33.34■■■□□ 2.93
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Adamts13Q769J6 1426 aa33.34■■■□□ 2.93
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Usp47Q8BY87 1376 aa33.34■■■□□ 2.93
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm10563F6WIE4 79 aa33.34■■■□□ 2.93
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa33.32■■■□□ 2.92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 KdrP35918 1367 aa33.31■■■□□ 2.92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slit2Q9R1B9 1521 aa33.31■■■□□ 2.92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Q3UJC8 639 aa33.3■■■□□ 2.92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Eid3Q3V124 375 aa33.3■■■□□ 2.92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cypt2Q6P924 180 aa33.3■■■□□ 2.92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mier1Q5UAK0 511 aa33.28■■■□□ 2.92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zfp142G5E869 1843 aa33.28■■■□□ 2.92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sema6bO54951 886 aa33.26■■■□□ 2.92
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