Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55,78■■■■■ 6,52
AU022751B1B0V2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51,72■■■■■ 5,87
AU022751B1B0V2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,84■■■■■ 5,73
AU022751B1B0V2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48,58■■■■■ 5,37
AU022751B1B0V2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48,38■■■■■ 5,34
AU022751B1B0V2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47,42■■■■■ 5,18
AU022751B1B0V2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,11■■■■■ 5,13
AU022751B1B0V2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,94■■■■■ 5,1
AU022751B1B0V2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46,61■■■■■ 5,05
AU022751B1B0V2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,45■■■■■ 5,03
AU022751B1B0V2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46,43■■■■■ 5,02
AU022751B1B0V2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,35■■■■■ 5,01
AU022751B1B0V2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,7■■■■■ 4,91
AU022751B1B0V2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45,33■■■■■ 4,85
AU022751B1B0V2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,24■■■■■ 4,83
AU022751B1B0V2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45,01■■■■■ 4,8
AU022751B1B0V2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,86■■■■■ 4,77
AU022751B1B0V2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44,76■■■■■ 4,76
AU022751B1B0V2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44,73■■■■■ 4,75
AU022751B1B0V2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,72■■■■■ 4,75
AU022751B1B0V2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,36■■■■■ 4,69
AU022751B1B0V2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,34■■■■■ 4,69
AU022751B1B0V2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,24■■■■■ 4,67
AU022751B1B0V2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44,21■■■■■ 4,67
AU022751B1B0V2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,18■■■■■ 4,66
AU022751B1B0V2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44,17■■■■■ 4,66
AU022751B1B0V2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,14■■■■■ 4,66
AU022751B1B0V2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
AU022751B1B0V2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43,99■■■■■ 4,63
AU022751B1B0V2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,8■■■■■ 4,6
AU022751B1B0V2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,75■■■■■ 4,59
AU022751B1B0V2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,64■■■■■ 4,58
AU022751B1B0V2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43,4■■■■■ 4,54
AU022751B1B0V2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43,18■■■■■ 4,5
AU022751B1B0V2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,12■■■■■ 4,49
AU022751B1B0V2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,98■■■■■ 4,47
AU022751B1B0V2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42,89■■■■■ 4,46
AU022751B1B0V2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42,79■■■■■ 4,44
AU022751B1B0V2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,75■■■■■ 4,43
AU022751B1B0V2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,73■■■■■ 4,43
AU022751B1B0V2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
AU022751B1B0V2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42,63■■■■■ 4,41
AU022751B1B0V2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42,51■■■■■ 4,4
AU022751B1B0V2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42,42■■■■■ 4,38
AU022751B1B0V2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42,37■■■■■ 4,37
AU022751B1B0V2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42,29■■■■■ 4,36
AU022751B1B0V2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42,24■■■■■ 4,35
AU022751B1B0V2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,23■■■■■ 4,35
AU022751B1B0V2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
AU022751B1B0V2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,93■■■■■ 4,3
AU022751B1B0V2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41,76■■■■■ 4,28
AU022751B1B0V2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,7■■■■■ 4,27
AU022751B1B0V2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41,69■■■■■ 4,26
AU022751B1B0V2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41,66■■■■■ 4,26
AU022751B1B0V2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,63■■■■■ 4,26
AU022751B1B0V2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41,53■■■■■ 4,24
AU022751B1B0V2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41,51■■■■■ 4,24
AU022751B1B0V2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41,51■■■■■ 4,24
AU022751B1B0V2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41,44■■■■■ 4,22
AU022751B1B0V2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41,44■■■■■ 4,22
AU022751B1B0V2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41,43■■■■■ 4,22
AU022751B1B0V2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41,43■■■■■ 4,22
AU022751B1B0V2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
AU022751B1B0V2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
AU022751B1B0V2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
AU022751B1B0V2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
AU022751B1B0V2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41,35■■■■■ 4,21
AU022751B1B0V2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41,19■■■■■ 4,18
AU022751B1B0V2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,15■■■■■ 4,18
AU022751B1B0V2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
AU022751B1B0V2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,13■■■■■ 4,17
AU022751B1B0V2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41,09■■■■■ 4,17
AU022751B1B0V2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,06■■■■■ 4,16
AU022751B1B0V2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
AU022751B1B0V2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
AU022751B1B0V2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,97■■■■■ 4,15
AU022751B1B0V2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
AU022751B1B0V2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
AU022751B1B0V2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40,81■■■■■ 4,12
AU022751B1B0V2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
AU022751B1B0V2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
AU022751B1B0V2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
AU022751B1B0V2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
AU022751B1B0V2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40,62■■■■■ 4,09
AU022751B1B0V2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40,6■■■■■ 4,09
AU022751B1B0V2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
AU022751B1B0V2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
AU022751B1B0V2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
AU022751B1B0V2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
AU022751B1B0V2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40,41■■■■■ 4,06
AU022751B1B0V2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
AU022751B1B0V2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
AU022751B1B0V2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40,31■■■■■ 4,04
AU022751B1B0V2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
AU022751B1B0V2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,23■■■■■ 4,03
AU022751B1B0V2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
AU022751B1B0V2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40,22■■■■■ 4,03
AU022751B1B0V2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
AU022751B1B0V2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40,12■■■■■ 4,01
AU022751B1B0V2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,1■■■■■ 4,01
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