RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165953.2

Nelfe-202, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa52,9■■■■■ 6,06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NischQ80TM9 1593 aa52,12■■■■■ 5,93
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Abcc8B2RUS7 1588 aa50,45■■■■■ 5,67
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Abcc9P70170 1546 aa50,37■■■■■ 5,65
Nelfe-202ENSMUST00000165953 ScribQ80U72 1612 aa48,87■■■■■ 5,41
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NacadQ5SWP3 1504 aa47,27■■■■■ 5,16
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kdm5dQ62240 1548 aa47,18■■■■■ 5,14
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sycp2Q9CUU3 1500 aa46,35■■■■■ 5,01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dcaf1Q80TR8 1506 aa46,28■■■■■ 5
Nelfe-202ENSMUST00000165953 BicraF8VPZ9 1578 aa45,78■■■■■ 4,92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa45,42■■■■■ 4,86
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa45,05■■■■■ 4,8
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rhox8Q6VSS7 320 aa44,82■■■■■ 4,77
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Baz1aO88379 1555 aa44,72■■■■■ 4,75
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc180J3QNE4 1664 aa44,6■■■■■ 4,73
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP44,55■■■■■ 4,72
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Crybg2B7ZCC2 1516 aa44,52■■■■■ 4,72
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP44,31■■■■■ 4,68
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP44,2■■■■■ 4,67
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP44,06■■■■■ 4,64
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ercc6F8VPZ5 1481 aa43,65■■■■■ 4,58
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa43,64■■■■■ 4,58
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP43,61■■■■■ 4,57
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Smarca2Q6DIC0 1577 aa43,57■■■■■ 4,57
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa43,44■■■■■ 4,54
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa43,4■■■■■ 4,54
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fam135aQ6NS59 1506 aa43,23■■■■■ 4,51
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Wdr62Q3U3T8 1523 aa43,08■■■■■ 4,49
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Frmpd1A2AKB4 1549 aa43,03■■■■■ 4,48
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP42,86■■■■■ 4,45
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Baz1bQ9Z277 1479 aa42,63■■■■■ 4,41
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ubl4bQ9CQ84 188 aa42,54■■■■■ 4,4
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Unc13aQ4KUS2 1712 aa42,5■■■■■ 4,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rtl1Q7M732 1744 aa42,49■■■■■ 4,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CftrP26361 1476 aa42,33■■■■■ 4,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa42,32■■■■■ 4,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Synj1Q8CHC4 1574 aa42,25■■■■■ 4,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mrc2Q64449 1479 aa42,24■■■■■ 4,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP42,14■■■■■ 4,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42,01■■■■■ 4,32
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP41,66■■■■■ 4,26
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP41,46■■■■■ 4,23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cux2P70298 1426 aa41,46■■■■■ 4,23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif15Q6P9L6 1387 aa41,44■■■■■ 4,22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa41,39■■■■■ 4,22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trim41Q5NCC3 630 aa41,31■■■■■ 4,2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif21aQ9QXL2 1672 aa41,25■■■■■ 4,19
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lamc3Q9R0B6 1581 aa41,17■■■■■ 4,18
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dnajc5P60904 198 aa41,04■■■■■ 4,16
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP41,03■■■■■ 4,16
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cep164Q5DU05 1446 aa40,84■■■■■ 4,13
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP40,77■■■■■ 4,12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Il27Q8K3I6 234 aa40,62■■■■■ 4,09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 TnnQ80Z71 1560 aa40,61■■■■■ 4,09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc18Q640L5 1455 aa40,6■■■■■ 4,09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP40,57■■■■■ 4,08
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP40,56■■■■■ 4,08
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Top2bQ64511 1612 aa40,55■■■■■ 4,08
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Golga3P55937 1487 aa40,55■■■■■ 4,08
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cngb1E1AZ71 1325 aa40,5■■■■■ 4,07
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plb1Q3TTY0 1478 aa40,49■■■■■ 4,07
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Camsap1A2AHC3 1581 aa40,42■■■■■ 4,06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP40,42■■■■■ 4,06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Shroom2A2ALU4 1481 aa40,41■■■■■ 4,06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Crocc2F6XLV1 1638 aa40,38■■■■■ 4,05
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP40,16■■■■■ 4,02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fmn1Q05860 1466 aa40,15■■■■■ 4,02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ift140E9PY46 1464 aa40,09■■■■■ 4,01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rusc2Q80U22 1514 aa40,03■■■■■ 4
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP40,01■■■■■ 4
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Duox2A2AQ99 1517 aa39,97■■■■□ 3,99
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Col17a1Q07563 1470 aa39,93■■■■□ 3,98
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Grin2bQ01097 1482 aa39,83■■■■□ 3,97
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP39,82■■■■□ 3,96
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Disp1Q3TDN0 1521 aa39,77■■■■□ 3,96
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Samd9lQ69Z37 1561 aa39,68■■■■□ 3,94
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Setd1bQ8CFT2 1985 aa39,65■■■■□ 3,94
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP39,59■■■■□ 3,93
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP39,58■■■■□ 3,93
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Efcab5A0JP43 1406 aa39,56■■■■□ 3,92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa39,54■■■■□ 3,92
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP39,45■■■■□ 3,91
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rad54l2Q99NG0 1466 aa39,44■■■■□ 3,9
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa39,41■■■■□ 3,9
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Grin2aP35436 1464 aa39,33■■■■□ 3,89
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP39,31■■■■□ 3,88
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Magi3Q9EQJ9 1476 aa39,3■■■■□ 3,88
Nelfe-202ENSMUST00000165953 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP39,28■■■■□ 3,88
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NrkQ9R0G8 1455 aa39,28■■■■□ 3,88
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fgd6Q69ZL1 1399 aa39,19■■■■□ 3,86
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Shroom4Q1W617 1475 aa39,12■■■■□ 3,85
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PtprkP35822 1457 aa39,11■■■■□ 3,85
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Chic1Q8CBW7 227 aa39,1■■■■□ 3,85
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Adgrl3Q80TS3 1537 aa39,07■■■■□ 3,84
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pla2r1Q62028 1487 aa39,04■■■■□ 3,84
Nelfe-202ENSMUST00000165953 SynmQ70IV5 1561 aa39,03■■■■□ 3,84
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cep170Q6A065 1588 aa39,01■■■■□ 3,84
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa39■■■■□ 3,83
Nelfe-202ENSMUST00000165953 AknaQ80VW7 1404 aa38,97■■■■□ 3,83
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gpatch8A2A6A1 1505 aa38,95■■■■□ 3,83
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