Protein–RNA interactions for Protein: Q6TXD4

Dnmbp, Dynamin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DnmbpQ6TXD4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55,98■■■■■ 6,55
DnmbpQ6TXD4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52,36■■■■■ 5,97
DnmbpQ6TXD4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,21■■■■■ 5,79
DnmbpQ6TXD4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49,11■■■■■ 5,45
DnmbpQ6TXD4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48,05■■■■■ 5,28
DnmbpQ6TXD4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,37■■■■■ 5,17
DnmbpQ6TXD4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47,28■■■■■ 5,16
DnmbpQ6TXD4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,1■■■■■ 5,13
DnmbpQ6TXD4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46,92■■■■■ 5,1
DnmbpQ6TXD4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,86■■■■■ 5,09
DnmbpQ6TXD4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46,61■■■■■ 5,05
DnmbpQ6TXD4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,45■■■■■ 5,03
DnmbpQ6TXD4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46,05■■■■■ 4,96
DnmbpQ6TXD4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,73■■■■■ 4,91
DnmbpQ6TXD4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45,68■■■■■ 4,9
DnmbpQ6TXD4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,54■■■■■ 4,88
DnmbpQ6TXD4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,52■■■■■ 4,88
DnmbpQ6TXD4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45,49■■■■■ 4,87
DnmbpQ6TXD4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,87■■■■■ 4,77
DnmbpQ6TXD4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,69■■■■■ 4,74
DnmbpQ6TXD4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,67■■■■■ 4,74
DnmbpQ6TXD4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44,6■■■■■ 4,73
DnmbpQ6TXD4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,52■■■■■ 4,72
DnmbpQ6TXD4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44,43■■■■■ 4,7
DnmbpQ6TXD4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44,26■■■■■ 4,68
DnmbpQ6TXD4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,93■■■■■ 4,62
DnmbpQ6TXD4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43,74■■■■■ 4,59
DnmbpQ6TXD4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43,74■■■■■ 4,59
DnmbpQ6TXD4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43,67■■■■■ 4,58
DnmbpQ6TXD4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
DnmbpQ6TXD4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,4■■■■■ 4,54
DnmbpQ6TXD4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,34■■■■■ 4,53
DnmbpQ6TXD4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
DnmbpQ6TXD4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,05■■■■■ 4,48
DnmbpQ6TXD4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43,02■■■■■ 4,48
DnmbpQ6TXD4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
DnmbpQ6TXD4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
DnmbpQ6TXD4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42,97■■■■■ 4,47
DnmbpQ6TXD4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42,96■■■■■ 4,47
DnmbpQ6TXD4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42,75■■■■■ 4,43
DnmbpQ6TXD4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,74■■■■■ 4,43
DnmbpQ6TXD4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42,73■■■■■ 4,43
DnmbpQ6TXD4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42,69■■■■■ 4,43
DnmbpQ6TXD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,61■■■■■ 4,41
DnmbpQ6TXD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42,58■■■■■ 4,41
DnmbpQ6TXD4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,5■■■■■ 4,39
DnmbpQ6TXD4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42,39■■■■■ 4,38
DnmbpQ6TXD4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,3■■■■■ 4,36
DnmbpQ6TXD4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42,22■■■■■ 4,35
DnmbpQ6TXD4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42,14■■■■■ 4,34
DnmbpQ6TXD4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
DnmbpQ6TXD4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42,04■■■■■ 4,32
DnmbpQ6TXD4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,04■■■■■ 4,32
DnmbpQ6TXD4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42,01■■■■■ 4,32
DnmbpQ6TXD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,87■■■■■ 4,29
DnmbpQ6TXD4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,82■■■■■ 4,29
DnmbpQ6TXD4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41,78■■■■■ 4,28
DnmbpQ6TXD4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41,72■■■■■ 4,27
DnmbpQ6TXD4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41,54■■■■■ 4,24
DnmbpQ6TXD4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
DnmbpQ6TXD4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
DnmbpQ6TXD4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
DnmbpQ6TXD4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
DnmbpQ6TXD4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
DnmbpQ6TXD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41,33■■■■■ 4,21
DnmbpQ6TXD4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41,31■■■■■ 4,2
DnmbpQ6TXD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41,28■■■■■ 4,2
DnmbpQ6TXD4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
DnmbpQ6TXD4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
DnmbpQ6TXD4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41,16■■■■■ 4,18
DnmbpQ6TXD4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,92■■■■■ 4,14
DnmbpQ6TXD4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
DnmbpQ6TXD4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
DnmbpQ6TXD4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,84■■■■■ 4,13
DnmbpQ6TXD4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
DnmbpQ6TXD4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,75■■■■■ 4,11
DnmbpQ6TXD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
DnmbpQ6TXD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40,69■■■■■ 4,1
DnmbpQ6TXD4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
DnmbpQ6TXD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
DnmbpQ6TXD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
DnmbpQ6TXD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40,62■■■■■ 4,09
DnmbpQ6TXD4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
DnmbpQ6TXD4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
DnmbpQ6TXD4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,42■■■■■ 4,06
DnmbpQ6TXD4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
DnmbpQ6TXD4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,04
DnmbpQ6TXD4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
DnmbpQ6TXD4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40,28■■■■■ 4,04
DnmbpQ6TXD4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
DnmbpQ6TXD4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
DnmbpQ6TXD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40,23■■■■■ 4,03
DnmbpQ6TXD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40,15■■■■■ 4,02
DnmbpQ6TXD4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
DnmbpQ6TXD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40,1■■■■■ 4,01
DnmbpQ6TXD4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4,01
DnmbpQ6TXD4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
DnmbpQ6TXD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
DnmbpQ6TXD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,03■■■■■ 4
DnmbpQ6TXD4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,3 ms