RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP44■■■■■ 4,63
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rgl3Q3UYI5 709 aa43,95■■■■■ 4,63
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dip2aQ8BWT5 1523 aa43,95■■■■■ 4,63
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Txndc2Q6P902 515 aa43,92■■■■■ 4,62
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP43,9■■■■■ 4,62
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa43,89■■■■■ 4,62
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP43,85■■■■■ 4,61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP43,83■■■■■ 4,61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P3h3Q8CG70 732 aa43,81■■■■■ 4,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AU022751B1B0V2 589 aa43,8■■■■■ 4,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Scn4aQ9ER60 1841 aa43,79■■■■■ 4,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Psme1P97371 249 aa43,78■■■■■ 4,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tulp4Q9JIL5 1547 aa43,77■■■■■ 4,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adamts13Q769J6 1426 aa43,77■■■■■ 4,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP43,76■■■■■ 4,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PplQ9R269 1755 aa43,75■■■■■ 4,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ncoa1P70365 1447 aa43,73■■■■■ 4,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa43,72■■■■■ 4,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rims2Q9EQZ7 1530 aa43,72■■■■■ 4,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rims1Q99NE5 1463 aa43,72■■■■■ 4,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa43,72■■■■■ 4,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TonslQ6NZL6 1363 aa43,71■■■■■ 4,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa43,71■■■■■ 4,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm13695A2AK44 830 aa43,69■■■■■ 4,58
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa43,68■■■■■ 4,58
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PalldQ9ET54 1408 aa43,65■■■■■ 4,58
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa43,63■■■■■ 4,57
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP43,62■■■■■ 4,57
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP43,61■■■■■ 4,57
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Myo3aQ8K3H5 1613 aa43,6■■■■■ 4,57
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp1b4Q99ME6 356 aa43,59■■■■■ 4,57
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Neurod1Q60867 357 aa43,58■■■■■ 4,57
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pip4k2bQ80XI4 416 aa43,58■■■■■ 4,57
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP43,56■■■■■ 4,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Polr3aB2RXC6 1390 aa43,55■■■■■ 4,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef28P97433 1693 aa43,55■■■■■ 4,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa43,55■■■■■ 4,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 IghaA0A0A6YXW6 389 aa43,55■■■■■ 4,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP43,53■■■■■ 4,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc52a2Q9D8F3 450 aa43,53■■■■■ 4,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Shq1Q7TMX5 569 aa43,51■■■■■ 4,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kdm2aP59997 1161 aa43,51■■■■■ 4,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slit3Q9WVB4 1523 aa43,5■■■■■ 4,55
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP43,5■■■■■ 4,55
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP43,49■■■■■ 4,55
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP43,48■■■■■ 4,55
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q9D9H8 365 aa43,48■■■■■ 4,55
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Setd1aE9PYH6 1716 aa43,45■■■■■ 4,55
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Asxl2Q8BZ32 1370 aa43,44■■■■■ 4,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mbd5B1AYB6 1498 aa43,44■■■■■ 4,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa43,44■■■■■ 4,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rapgef3Q8VCC8 918 aa43,44■■■■■ 4,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PzpQ61838 1495 aa43,41■■■■■ 4,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Os9Q8K2C7 672 aa43,4■■■■■ 4,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Med1Q925J9 1575 aa43,4■■■■■ 4,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm20521D3Z5F7 333 aa43,39■■■■■ 4,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fan1Q69ZT1 1020 aa43,38■■■■■ 4,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mug2P28666 1451 aa43,38■■■■■ 4,53
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MaddQ80U28 1577 aa43,32■■■■■ 4,53
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pik3r4Q8VD65 1358 aa43,32■■■■■ 4,53
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP43,31■■■■■ 4,52
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa43,25■■■■■ 4,51
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dapk1Q80YE7 1442 aa43,22■■■■■ 4,51
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arap3Q8R5G7 1538 aa43,2■■■■■ 4,51
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrrc7Q80TE7 1490 aa43,18■■■■■ 4,5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa43,16■■■■■ 4,5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP43,15■■■■■ 4,5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rundc1Q0VDN7 615 aa43,14■■■■■ 4,5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa43,13■■■■■ 4,5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stk26Q99JT2 416 aa43,13■■■■■ 4,49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP43,12■■■■■ 4,49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa43,11■■■■■ 4,49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Usp40Q8BWR4 1235 aa43,09■■■■■ 4,49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa43,09■■■■■ 4,49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP43,08■■■■■ 4,49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gli3Q61602 1583 aa43,07■■■■■ 4,49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Card11Q8CIS0 1159 aa43,07■■■■■ 4,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stard8Q8K031 1019 aa43,07■■■■■ 4,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa43,05■■■■■ 4,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 IqubQ8CDK3 788 aa43,05■■■■■ 4,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cps1Q8C196 1500 aa43,05■■■■■ 4,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa43,04■■■■■ 4,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nphp4P59240 1425 aa43,03■■■■■ 4,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plekhg1F6S200 1446 aa43,02■■■■■ 4,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tns3Q5SSZ5 1440 aa43,01■■■■■ 4,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DnmbpQ6TXD4 1580 aa42,99■■■■■ 4,47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa42,97■■■■■ 4,47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stag3O70576 1240 aa42,96■■■■■ 4,47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cep170bQ80U49 1574 aa42,96■■■■■ 4,47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Srcin1Q9QWI6 1250 aa42,95■■■■■ 4,47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ift172Q6VH22 1749 aa42,89■■■■■ 4,46
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Col18a1P39061 1774 aa42,83■■■■■ 4,45
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rock2P70336 1388 aa42,82■■■■■ 4,44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem94Q7TSH8 1360 aa42,81■■■■■ 4,44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa42,79■■■■■ 4,44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slain2Q8CI08 581 aa42,79■■■■■ 4,44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa42,76■■■■■ 4,44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q3UJC8 639 aa42,75■■■■■ 4,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa42,74■■■■■ 4,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zbtb4Q5F293 982 aa42,74■■■■■ 4,43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32,6 ms