RNA–Protein interactions for RNA: YGR174C

CBP4, Transcript of Mitochondrial protein required for assembly of cytochrome bc1 complex, yeast

Gene CBP4, Length 513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP4	YGR174C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YJR056C	P47115	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ILM1	P47155	203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YIP1	P53039	248 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YGL204C	P53089	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	PAU12	P53343	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	TAF3	Q12297	353 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	BBP1	Q12365	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	COX9	P07255	59 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	PET122	P10355	254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MIG1	P27705	504 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	AST1	P35183	429 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YKL075C	P36083	450 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	PHB2	P50085	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ATG17	Q06410	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	VAM3	Q12241	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	AHC2	P25649	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YBL010C	P32788	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	PAU24	P38155	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	SDS24	P38314	527 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	RTT105	P40063	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	AGE2	P40529	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	NRG1	Q03125	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	HLR1	Q04429	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MCM21	Q06675	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	FRE6	Q12473	712 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YKL063C	P35725	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	UMP1	P38293	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	BUD8	P41698	603 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	HSK3	P69852	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MDM36	Q06820	579 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	HUT1	Q12520	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	DOA4	P32571	926 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	SFK1	P35735	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	NVJ1	P38881	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	GRX5	Q02784	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	TLG1	Q03322	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	SPG4	Q04438	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
CBP4	YGR174C	ATG22	P25568	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ARO7	P32178	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ZRT3	P34240	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	PMU1	P36069	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MSS2	P40990	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	CTF19	Q02732	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ORT1	Q12375	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	TRM10	Q12400	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	GCN4	P03069	281 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ERG2	P32352	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	PAU2	P32612	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	CPR5	P35176	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
CBP4	YGR174C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	YBR285W	P38354	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	AVT6	P40074	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	TMA10	Q06177	86 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	ASR1	Q06834	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	JID1	Q12350	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	MED11	Q99278	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP4	YGR174C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBP4	YGR174C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBP4	YGR174C	YCR061W	P25639	631 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP4	YGR174C	ERG3	P32353	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP4	YGR174C	SRY1	P36007	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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