RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MAM33	P40513	266 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YFL064C	P43540	174 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MOB2	P43563	287 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RRT5	P43607	289 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PCP1	P53259	346 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PDR17	P53844	350 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	UBC7	Q02159	165 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YMR206W	Q03695	313 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	TRS23	Q03784	219 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	DPP1	Q05521	289 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	GLO2	Q05584	274 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	BNA5	Q05979	453 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	GAS2	Q06135	555 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YLR012C	Q07927	99 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	ATP14	Q12349	124 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PEX11	Q12462	236 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YPR064W	Q12492	139 aa		3.85	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	IRA2	P19158	3079 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SUC2	P00724	532 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	HIS3	P06633	220 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	CTA1	P15202	515 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MRPL3	P36516	390 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	NVJ1	P38881	321 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.84	□□□□□ -1.79	not detected
KTR2	YKR061W	EXO1	P39875	702 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	FAU1	P40099	211 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	BUL1	P48524	976 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	TRM9	P49957	279 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YGR151C	P53287	111 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SWP1	Q02795	286 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RUB1	Q03919	77 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SWF1	Q04629	336 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	LDB18	Q07887	179 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YOL024W	Q08172	172 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MCH4	Q08268	501 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YPL257W	Q08974	193 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MDM32	Q12171	622 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	NCA2	Q12374	616 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RTR2	Q12378	196 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	LAS17	Q12446	633 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.84	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	TEL1	P38110	2787 aa		3.84	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	BAR1	P12630	587 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	FCY2	P17064	533 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YKL075C	P36083	450 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	POP4	P38336	279 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	AIM18	P38884	321 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YEL028W	P39989	153 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	GLE2	P40066	365 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	ARG2	P40360	574 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	FAR7	P43592	221 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	MCM22	P47167	239 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	TOS2	P50078	622 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	FLC3	P53121	802 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	NMA2	P53204	395 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	BUD32	P53323	261 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	SAE3	P89114	91 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	CDC14	Q00684	551 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	DML1	Q03652	475 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	USV1	Q12132	391 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YLR126C	Q12288	251 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.83	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	STE4	P18851	423 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	LSB5	P25369	354 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YBL010C	P32788	280 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.7 ms