RNA–Protein interactions for RNA: YJL099W

CHS6, Transcript of Member of the ChAPs (Chs5p-Arf1p-binding proteins) family, yeast

Gene CHS6, Length 2,241 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CHS6	YJL099W	GOS1	P38736	223 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	BIG1	P38813	335 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YJR056C	P47115	236 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YJR146W	P47174	117 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	GTR2	P53290	341 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	SNZ2	P53824	298 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	ABF2	Q02486	183 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	COQ10	Q08058	207 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YOR186W	Q08560	144 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	MSH5	Q12175	901 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	SWI1	P09547	1314 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	MSW1	P04803	379 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	SNA3	P14359	133 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	PEX4	P29340	183 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	DOA4	P32571	926 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	MSN4	P33749	630 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	PEP8	P40335	379 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YIL001W	P40560	513 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	CIS3	P47001	227 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	DAN1	P47178	298 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	NUP84	P52891	726 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YGL159W	P53110	370 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YML096W	Q04489	525 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YPR172W	Q06608	200 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.48	□□□□□ -2.33	not detected
CHS6	YJL099W	RRT8	Q08219	342 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	ATO3	Q12359	275 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	DSF1	P0CX08	502 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	MDH2	P22133	377 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YCR102C	P25608	368 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	RIB1	P38066	345 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	TCD1	P38756	429 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	DOG1	P38774	246 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YFR054C	P43622	192 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YJR079W	P47126	109 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YNR062C	P53748	327 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	PET117	Q02771	107 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	SRL4	Q03085	281 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	RSM10	Q03201	203 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YLR283W	Q05867	314 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	SEI1	Q06058	285 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	NEJ1	Q06148	342 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	ATG39	Q06159	398 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YLR030W	Q07967	263 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YOR029W	Q12243	111 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	TPO4	Q12256	659 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YLR126C	Q12288	251 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	INO80	P53115	1489 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CHS6	YJL099W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	FCY2	P17064	533 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	YKL075C	P36083	450 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	MSA2	P36157	363 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	SKG1	P36169	355 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	ERV15	P38312	142 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	AYR1	P40471	297 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	YKE4	P40544	346 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	GLG2	P47011	380 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	HOC1	P47124	396 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	MCM22	P47167	239 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	CAB4	P53332	305 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	YNL046W	P53956	172 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	DCR2	Q05924	578 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	COX5A	P00424	153 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	CDC8	P00572	216 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	ERD2	P18414	219 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	MRPS28	P21771	286 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	ATG22	P25568	528 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	OAC1	P32332	324 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	YBR063C	P38083	404 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	LDB7	P38210	180 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	YBR096W	P38256	230 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	DSE2	P38844	325 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	SVP26	P38869	228 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	CAT5	P41735	233 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	PRM10	P42946	383 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CHS6	YJL099W	YGL034C	P53186	121 aa		0.46	□□□□□ -2.34

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