RNA–Protein interactions for RNA: YGR058W

PEF1, Transcript of Penta-EF-hand protein, yeast

Gene PEF1, Length 1,008 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEF1	YGR058W	FES1	P38260	290 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	ARN2	P38724	620 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	WSS1	P38838	269 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	PEX18	P38855	283 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	ICE2	P40499	491 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	KEG1	P43614	200 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YGL235W	P53071	178 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	TPC1	P53257	314 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	RRN9	P53437	365 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YDR541C	Q03049	344 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	SRL4	Q03085	281 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	GAL83	Q04739	417 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YLR456W	Q06199	204 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	AEP3	Q12089	606 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	SIA1	Q12212	622 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	RNH203	Q12338	110 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	HFA1	P32874	2273 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	OPI3	P05375	206 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YOL162W	P0CF19	215 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	PBN1	P25580	416 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	STP22	P25604	385 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	ITR2	P30606	609 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	TAF14	P35189	244 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	DDI1	P40087	428 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	EFM3	P47163	339 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	SHE4	P51534	789 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	PMT5	P52867	743 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YGR266W	P53326	701 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	NRM1	P53718	249 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	NUP49	Q02199	472 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	URC2	Q04411	772 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	ELP6	Q04868	273 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	NEJ1	Q06148	342 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	MSH5	Q12175	901 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YOR214C	Q12282	236 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YDR061W	Q12298	539 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YOP1	Q12402	180 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	APC2	Q12440	853 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	PCL9	Q12477	304 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	IRA1	P18963	3092 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	REP1	P03871	373 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	MET2	P08465	486 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	ERD1	P16151	362 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -1.99	not detected
PEF1	YGR058W	SNF6	P18888	332 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	GPI12	P23797	304 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	SUR1	P33300	382 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	VPS51	P36116	164 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	FMP23	P38231	175 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	ECM34	P38728	170 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	APS3	P47064	194 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	ABM1	P47146	123 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	NCE101	Q02820	53 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	SNZ1	Q03148	297 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	INP1	Q03694	420 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	OST6	Q03723	332 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	GPI17	Q04080	534 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	ARV1	Q06541	321 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	SPC3	Q12133	184 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	TPO4	Q12256	659 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	IES3	Q12345	250 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PEF1	YGR058W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	PDX1	P16451	410 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	CPR2	P23285	205 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	PMT2	P31382	759 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	PDC2	P32896	925 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	TIR2	P33890	251 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	TPO5	P36029	618 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	GEP4	P38812	185 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	STB1	P42845	420 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	TRM9	P49957	279 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	YGL101W	P53144	215 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	YGR067C	P53243	804 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	MAK3	Q03503	176 aa		2.58	□□□□□ -2
PEF1	YGR058W	RCF1	Q03713	159 aa		2.58	□□□□□ -2

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