RNA–Protein interactions for RNA: YBR217W

ATG12, Transcript of Ubiquitin-like modifier involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG12, Length 561 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	YBR217W	NAT2	P37293	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	FMP23	P38231	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	JLP2	P40206	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YIL060W	P40519	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	ABM1	P47146	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	FMP48	P53233	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YNR064C	P53750	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	RCF1	Q03713	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	PEX27	Q08580	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	ATG41	Q12048	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MRPS28	P21771	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	RPB9	P27999	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	PRE4	P30657	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MRPL36	P36531	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MSS4	P38994	779 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	IES5	P40060	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	ATG18	P43601	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	BXI1	P48558	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MRH4	P53166	561 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	APJ1	P53940	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	CTF19	Q02732	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	PRM15	Q03262	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TDA1	Q03533	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MCM21	Q06675	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	ODC2	Q99297	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	FIG1	P38224	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	OSH7	P38755	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	LNP1	P38878	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	RTT105	P40063	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	PIR5	P46999	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	VHT1	P53241	593 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GRC3	Q07845	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	IRC25	Q07951	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	INP53	Q12271	1107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	CCW14	O13547	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	SPS4	P09937	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	PET122	P10355	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	VMA3	P25515	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	AGA2	P32781	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GPI18	P38211	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	SYS1	P41544	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	BNA6	P43619	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MRX5	P47007	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YGR042W	P53227	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	ERV29	P53337	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	WSC2	P53832	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	RIM9	Q04734	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	FMP42	Q04991	504 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MSH5	Q12175	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	RFM1	Q12192	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	PEX4	P29340	183 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	IES6	P32617	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	SWD3	P38123	315 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	AIM46	P38885	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	GWT1	P47026	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	LIP2	Q06005	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	WHI5	Q12416	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	ATG40	Q99325	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	URA6	P15700	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	RNP1	P32385	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	YHK8	P38776	514 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	MIT1	P40002	666 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	CAT5	P41735	233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	OTU1	P43558	301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	XPT1	P47165	209 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	UPS1	Q05776	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	CHO1	P08456	276 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG12	YBR217W	ATP10	P18496	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.4 ms