RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	ATP10	P18496	279 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.3	□□□□□ -1.88	not detected
XRS2	YDR369C	TMT1	P32643	299 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	UGX2	P32772	223 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	OMA1	P36163	345 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	LDB7	P38210	180 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	DER1	P38307	211 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YHR033W	P38690	423 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YHC3	P47040	408 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	IKS1	P47042	667 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	EAF6	P47128	113 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MIC26	P50087	233 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MTC3	P53077	123 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YAP1802	P53309	568 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ATG4	P53867	494 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ASI3	P53983	676 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YKR011C	Q02209	353 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	CCE1	Q03702	353 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YMR160W	Q03823	816 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TDA6	Q06466	467 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YOL114C	Q12322	202 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TFS1	P14306	219 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	POP5	P28005	173 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	KKQ8	P36004	724 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	VRP1	P37370	817 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GAA1	P39012	614 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PAC2	P39937	518 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	FKH2	P41813	862 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	JJJ3	P47138	172 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PUS2	P53167	370 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SWC7	Q06707	132 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MCH1	Q07376	486 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MCA1	Q08601	432 aa		3.3	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	QCR7	P00128	127 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-C	P25383	438 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	OAC1	P32332	324 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HOG1	P32485	435 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ASK1	P35734	292 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RRG9	P40156	214 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	FIS1	P40515	155 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NAS2	P40555	220 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GTS1	P40956	396 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NIF3	P53081	288 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SGF73	P53165	657 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MRPL19	P53875	158 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	APJ1	P53940	528 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	INM2	Q05533	292 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BSP1	Q06604	576 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NBP2	Q12163	236 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	COX3	P00420	269 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RIP1	P08067	215 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MSN1	P22148	382 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	EMC3	P36039	253 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TRS20	P38334	175 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	IRC22	P40006	225 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YJL068C	P40363	299 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MPM1	P40364	252 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	COA1	P40452	197 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YIL060W	P40519	144 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YGR066C	P53242	292 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YNL092W	P53934	400 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	CDC55	Q00362	526 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ATG21	Q02887	496 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SCW10	Q04951	389 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BNA5	Q05979	453 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TGL5	Q12043	749 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ATG41	Q12048	136 aa		3.29	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	CDC9	P04819	755 aa		3.28	□□□□□ -1.88

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