RNA–Protein interactions for RNA: YPR036W

VMA13, Transcript of Subunit H of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA13	YPR036W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MSK1	P32048	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TCA17	P32613	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SCO2	P38072	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ICS2	P38284	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	FAU1	P40099	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SLM1	P40485	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	HMS2	P47175	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PAC10	P48363	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YGR079W	P53249	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	NCE103	P53615	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	COG5	P53951	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TRM82	Q03774	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MED7	Q08278	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TMS1	Q12116	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MSB2	P32334	1306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PUT1	P09368	476 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PTP1	P25044	335 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ACH1	P32316	526 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MKK1	P32490	508 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YHR112C	P38716	378 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	IKI1	P38874	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	COX15	P40086	486 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	GAT2	P40209	560 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YGR201C	P42936	225 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ATG27	P46989	271 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	CCC1	P47818	322 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YGL235W	P53071	178 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SDT1	P53078	280 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YGR168C	P53293	376 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PLB2	Q03674	706 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YMD8	Q03697	442 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	GAL83	Q04739	417 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SFM1	Q12314	213 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	RPN13	O13563	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	ATP10	P18496	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	ARN2	P38724	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	ELO1	P39540	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MTL1	P53214	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YLR460C	P54007	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RSC9	Q03124	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RFU1	Q08003	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MRX4	Q12467	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SET6	Q12529	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	FSH3	Q99369	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SCEI	P03882	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SAM35	P14693	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RPB8	P20436	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	IES6	P32617	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	CLG1	P35190	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YKL162C	P36052	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	KAE1	P36132	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	BNA4	P38169	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SHG1	P38337	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YFR057W	P43625	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SFH5	P47008	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	HOC1	P47124	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	CDH1	P53197	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	BUD17	P53727	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	NUP49	Q02199	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RNH202	Q05635	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MDM30	Q05930	598 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	REP1	P03871	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	STE7	P06784	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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