RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W TUB4P53378 473 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YNR062CP53748 327 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W SCP1Q08873 200 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W GUP2Q08929 609 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YLR111WQ12528 110 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W DFG16Q99234 619 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W ODC2Q99297 307 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W FRS1P15624 595 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W IFM1P25038 676 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W TIM12P32830 109 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W SUI1P32911 108 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W PPZ2P33329 710 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W LDH1P38139 375 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W SHG1P38337 142 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W TAE1P38340 232 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W TRR2P38816 342 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W GPI14P47088 403 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W NIF3P53081 288 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W HDA2Q06629 674 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa9.36□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W CDC7P06243 507 aa9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W RNQ1P25367 405 aa9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W PRE2P30656 287 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W DBF20P32328 564 aa9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W VPS51P36116 164 aa9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W MRPL16P38064 232 aa9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W SMK1P41808 388 aa9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W ACT1P60010 375 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W BUD25P85052 153 aa9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W ARL3Q02804 198 aa9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W FUR4P05316 633 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YML003WP0CF16 290 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W MATALPHA1P0CY06 175 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W HMLALPHA1P0CY07 175 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W URA6P15700 204 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W AGP1P25376 633 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W MRPL37P36532 105 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YIR035CP40579 254 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W REC102Q02721 264 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W EST3Q03096 181 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W FIT1Q04433 528 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W MED4Q12343 284 aa9.34□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W TPI1P00942 248 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W ERG4P25340 473 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W MGR1P25573 417 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W TRR1P29509 319 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SRB5P32585 307 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YKL071WP36086 256 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W RPP1P38786 293 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W GPI16P38875 610 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W VNX1P42839 908 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YJL016WP47072 561 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SOL1P50278 321 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W PEF1P53238 335 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W RNH70P53331 553 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W AAH1P53909 347 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W APJ1P53940 528 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W PEX25Q02969 394 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YPR172WQ06608 200 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W ORT1Q12375 292 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SRF1Q12516 437 aa9.33□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W GLK1P17709 500 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W HNM1P19807 563 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W BUB3P26449 341 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W FMT1P32785 401 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W HXT5P38695 592 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SKN7P38889 622 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W RRD1P40454 393 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W AGX1P43567 385 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W MTM1P53320 366 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W NNT1Q05874 261 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W PFA4Q12006 378 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W PET20Q99373 253 aa9.32□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W NFS1P25374 497 aa9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data9.31□□□□□ -0.92not detected
PRP4YPR178W SPT10P35208 640 aa9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W VMA21P41806 77 aa9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W DUG1P43616 481 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W TIM21P53220 239 aa9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SCW4P53334 386 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W GPI15P53961 229 aa9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SYM1Q06563 197 aa9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa9.31□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W PET18P25362 215 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W PBN1P25580 416 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W DCG1P32460 244 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W ANS1P38832 159 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W PRP39P39682 629 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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