RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	HMS2	P47175	358 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	MRM2	P53123	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	YGR067C	P53243	804 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	RCF2	P53721	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	RMI1	Q02685	241 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	CSN9	Q03981	162 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	LOT6	Q07923	191 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	MMT2	Q08970	484 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	REX3	Q12090	404 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	ORT1	Q12375	292 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	STT4	P37297	1900 aa		4.15	□□□□□ -1.74
NMD4	YLR363C	SPT3	P06844	337 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	STF2	P16965	84 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	ZIP1	P31111	875 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	NTG1	P31378	399 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	KRE6	P32486	720 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YBL010C	P32788	280 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
NMD4	YLR363C	BMT2	P38278	337 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RPS27B	P38711	82 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	CUP9	P41817	306 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
NMD4	YLR363C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SPC2	Q04969	178 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
NMD4	YLR363C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	TPO4	Q12256	659 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RBD2	Q12270	262 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	ATP6	P00854	259 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	DOA4	P32571	926 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YBR137W	P38276	179 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	PEP8	P40335	379 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	ICE2	P40499	491 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	PAC11	P40960	533 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	ROG1	P53118	685 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	MTM1	P53320	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YNL140C	P53910	189 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YLR152C	P54072	576 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	BET5	Q03630	159 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	COS7	Q07788	383 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RUP1	Q12242	671 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RTR2	Q12378	196 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	TRP1	P00912	224 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	STE7	P06784	515 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	MXR2	P25566	168 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	DAL80	P26343	269 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	GPI16	P38875	610 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YJL055W	P47044	245 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	BIO4	P53630	237 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	APC4	Q04601	652 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	COA4	Q05809	96 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RIF2	Q06208	395 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	VAM3	Q12241	283 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	GRR1	P24814	1151 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	CTR86	P25355	563 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	TRX3	P25372	127 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RHB1	P25378	209 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	DOA1	P36037	715 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YBR062C	P38239	180 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	APE4	P38821	490 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	DDI1	P40087	428 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	COA1	P40452	197 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	PRM10	P42946	383 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	BIO3	P50277	480 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	AIF1	P52923	378 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	GTR2	P53290	341 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	RSN1	Q03516	953 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YPD1	Q07688	167 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NMD4	YLR363C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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