RNA–Protein interactions for RNA: YHR155W

YSP1, Transcript of Mitochondrial protein, yeast

Gene YSP1, Length 3,687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSP1	YHR155W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RRT12	P25381	491 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	TIR2	P33890	251 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RPC25	P35718	212 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	CAF4	P36130	643 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	INM1	P38710	295 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SCC4	P40090	624 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	TAD2	P47058	250 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	ILM1	P47155	203 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YML6	P51998	286 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	CLD1	P53264	445 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SLT2	Q00772	484 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.46	□□□□□ -2.34	not detected
YSP1	YHR155W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	FUS2	Q05670	677 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	MSC3	Q05812	728 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	NNT1	Q05874	261 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	BCP1	Q06338	283 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	LOT6	Q07923	191 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	GAT3	Q07928	141 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YOL029C	Q08187	201 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SAL1	D6W196	494 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RIB7	P33312	244 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	AST1	P35183	429 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	QDR3	P38227	689 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YHR045W	P38775	560 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SMF2	P38778	549 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RRT13	P40042	185 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YER188W	P40103	239 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SOK1	P40317	901 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YIL001W	P40560	513 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	BIO3	P50277	480 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	MRX11	Q03079	207 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YDR222W	Q04925	415 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YDR286C	Q05530	114 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	ASR1	Q06834	288 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RNH203	Q12338	110 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	LDB17	Q12342	491 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YPR064W	Q12492	139 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	MRPS28	P21771	286 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	MRPL25	P23369	157 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	ERG9	P29704	444 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SPO23	P33757	523 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RPC37	P36121	282 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	FZO1	P38297	855 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	STN1	P38960	494 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	KEG1	P43614	200 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	CIN2	P46670	268 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	COX16	P47081	118 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YNL095C	P53932	642 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SNX41	Q04053	625 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YPR172W	Q06608	200 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YDL109C	Q12103	647 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SCM3	Q12334	223 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	BBP1	Q12365	385 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	STE18	P18852	110 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	CWP1	P28319	239 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	LDS1	P31379	325 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	PMT2	P31382	759 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	PTM1	P32857	523 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RCK1	P38622	512 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YHR177W	P38867	453 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RMI1	Q02685	241 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YLR036C	Q07986	203 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YDL211C	Q12121	372 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YOP1	Q12402	180 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	LAG2	Q92325	660 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RAD9	P14737	1309 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	COX5A	P00424	153 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	SPT3	P06844	337 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YSP1	YHR155W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.7 ms