RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCB3	YJL134W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	NSG1	P38837	291 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YJL193W	P39542	402 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	HXT9	P40885	567 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	HXT11	P54862	567 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	TPP1	Q03796	238 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YMR252C	Q04814	134 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	TPO3	Q06451	622 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	ATG33	Q06485	197 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YPR196W	Q06595	470 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	ENB1	Q08299	606 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	GCN4	P03069	281 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PAU2	P32612	120 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	TRS65	P32893	560 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	CLG1	P35190	452 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YBR242W	P38331	238 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	VMA22	P38784	181 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RPP1	P38786	293 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	HPA3	P39979	161 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YIL067C	P40514	678 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	SHR5	P41912	237 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PMT6	P42934	759 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RPE1	P46969	238 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	NIT2	P47016	307 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	SAY1	P53324	424 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YGR266W	P53326	701 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	NCE103	P53615	221 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PLB2	Q03674	706 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	EKI1	Q03764	534 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	HLR1	Q04429	423 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	CYK3	Q07533	885 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	AIM6	Q07716	390 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	COQ10	Q08058	207 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YOL073C	Q08232	322 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	REX3	Q12090	404 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	COX9	P07255	59 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	STP22	P25604	385 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	ITR1	P30605	584 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	EMP70	P32802	667 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YHR180W	P38868	163 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MLH1	P38920	769 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MSS4	P38994	779 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	DOC1	P53068	250 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YLR456W	Q06199	204 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PHO92	Q06390	306 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MRPL35	Q06678	367 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	HRT1	Q08273	121 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RDR1	Q08904	546 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	ATG41	Q12048	136 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MCP1	Q12106	302 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	BAG7	Q12128	409 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RLM1	Q12224	676 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MTR10	Q99189	972 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	SOD2	P00447	233 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	HIS3	P06633	220 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PET54	P10834	293 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	CDC26	P14724	124 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	ATG22	P25568	528 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	CWH43	P25618	953 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PMT2	P31382	759 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RNP1	P32385	249 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	KRE6	P32486	720 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PPQ1	P32945	549 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	MSN4	P33749	630 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	not detected
LCB3	YJL134W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YHR210C	P38893	341 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	NAS2	P40555	220 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	SNO3	P43544	222 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	YFL054C	P43549	646 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LCB3	YJL134W	SSY1	Q03770	852 aa		5.66	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.9 ms