RNA–Protein interactions for RNA: YHR170W

NMD3, Transcript of Protein involved in nuclear export of the large ribosomal subunit, yeast

Gene NMD3, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD3	YHR170W	SNF6	P18888	332 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	OAC1	P32332	324 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	HIR2	P32480	875 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	CMC1	P36064	111 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	MRPL15	P36523	253 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YBR139W	P38109	508 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ICE2	P40499	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	SNO3	P43544	222 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	IDS2	P46958	469 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YGR067C	P53243	804 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	NUP49	Q02199	472 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	MAK3	Q03503	176 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	SPC3	Q12133	184 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	RKI1	Q12189	258 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	PSF1	Q12488	208 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	TFS1	P14306	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ERD1	P16151	362 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ERD2	P18414	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ARO7	P32178	256 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	NDC1	P32500	655 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YOR062C	P36025	268 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ASI1	P54074	624 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	PLM2	Q04383	521 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ARP10	Q04549	284 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ELP6	Q04868	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	SWT1	Q12104	458 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	RBD2	Q12270	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	STE4	P18851	423 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	EMP70	P32802	667 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	TAF14	P35189	244 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ARN2	P38724	620 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	VPS52	P39904	641 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	HXT14	P42833	540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YAT1	P80235	687 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	OST6	Q03723	332 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	FIN1	Q03898	291 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	FMP42	Q04991	504 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	HOF1	Q05080	669 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	CYK3	Q07533	885 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	TPO4	Q12256	659 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YRM1	Q12340	786 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	DAL82	P21705	255 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	HSP150	P32478	413 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	THI2	P38141	450 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ALP1	P38971	573 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	MIT1	P40002	666 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YFR054C	P43622	192 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	CTK2	P46962	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	NCE101	Q02820	53 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	TRS23	Q03784	219 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	SEI1	Q06058	285 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	UIP4	Q08926	304 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NMD3	YHR170W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	YPK2	P18961	677 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	TIM12	P32830	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	ECM15	P35195	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	TPO5	P36029	618 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	APL3	P38065	1025 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	YPK3	P38070	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	YHR035W	P38769	630 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	PEX18	P38855	283 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	MDM31	P38880	579 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	CIN1	P40987	1014 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	PAM16	P42949	149 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	IRC7	P43623	340 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	APS3	P47064	194 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	BUD17	P53727	317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	YNR062C	P53748	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	PGA1	P53896	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NMD3	YHR170W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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