RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B TIR2P33890 251 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B RXT2P38255 430 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B PPX1P38698 397 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SEO1P39709 593 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B CUP9P41817 306 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SIP4P46954 829 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YGL108CP53139 140 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B CIA1Q05583 330 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B GRX8Q05926 109 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B TSR2Q06672 205 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B PCL9Q12477 304 aa-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B TOP2P06786 1428 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YPT1P01123 206 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YGL041W-AP0C5N3 154 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YCP4P25349 247 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B RRP7P25368 297 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B CWP1P28319 239 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B ARO2P28777 376 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B ATP11P32453 318 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SPS19P32573 292 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B FZF1P32805 299 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SWC5P38326 303 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SIP3P38717 1229 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YIL152WP40455 235 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B URB2P47108 1174 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B RPN14P53196 417 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B RSF1Q05043 376 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SEC10Q06245 871 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B MCM21Q06675 368 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B LSP1Q12230 341 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YFR032C-BQ8TGU2 87 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B PDR18P53756 1333 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B MSI1P13712 422 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B MDL1P33310 695 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.75□□□□□ -2.53not detected
YHL009W-BYHL009W-B CAF4P36130 643 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YPT10P38146 199 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YMR144WP40214 342 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B MAD2P40958 196 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SNZ3P43545 298 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YJR146WP47174 117 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B KAP114P53067 1004 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YGL235WP53071 178 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YGR067CP53243 804 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B PXR1P53335 271 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B MDG1P53885 366 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B ARP5P53946 755 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YMR279CQ03263 540 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SPO77Q06134 477 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B NMD4Q12129 218 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B ATG34Q12292 412 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B GEP5Q12393 293 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.75□□□□□ -2.53not detected
YHL009W-BYHL009W-B SYN8P31377 255 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B NIP100P33420 868 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YPK3P38070 525 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YHL044WP38727 235 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B MOB2P43563 287 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YJL016WP47072 561 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B BXI1P48558 297 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B NAS6P50086 228 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B PRM1P53835 661 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SUR7P54003 302 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B VMS1Q04311 632 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B MIM1Q08176 113 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B ATX2Q12067 313 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B COX19Q3E731 98 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YER078W-AQ3E7A2 54 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SPS4P09937 338 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B PDB1P32473 366 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SKT5P34226 696 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B EDC2P40023 145 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B KAP123P40069 1113 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YNR068CP53754 272 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YNL190WP53872 204 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B CTF19Q02732 369 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YMD8Q03697 442 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B MLC2Q06580 163 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B ARG4P04076 463 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SGA1P08019 549 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B MATALPHA1P0CY06 175 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B HMLALPHA1P0CY07 175 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SPO16P17122 198 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B UGA1P17649 471 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B PRE7P23724 241 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SDH8P38345 138 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B TRM9P49957 279 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YKR005CQ02203 525 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B ODC1Q03028 310 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B SNX41Q04053 625 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B YLR297WQ05899 129 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B HRT1Q08273 121 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B AEP3Q12089 606 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B AGC1Q12482 902 aa-0.75□□□□□ -2.53
YHL009W-BYHL009W-B LEU2P04173 364 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
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