RNA–Protein interactions for RNA: YNL228W

YNL228W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL228W, Length 777 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL228W	YNL228W	CHL4	P38907	458 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	REE1	P40893	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	CDH1	P53197	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	CDC14	Q00684	551 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	FAR10	Q06001	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RSA1	Q08932	381 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	POF1	P25576	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	AIM29	P36154	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	SDS24	P38314	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RCK1	P38622	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	PET8	P38921	284 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YER186C	P40101	306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
YNL228W	YNL228W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	KRE28	Q04431	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	FDH1	Q08911	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	REV1	P12689	985 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	HIT1	P46973	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	TPC1	P53257	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	GMC1	Q04399	608 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	SFH1	Q06168	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	CTR3	Q06686	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	NDD1	Q08887	554 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YOS9	Q99220	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	PPA2	P28239	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	PFS1	P38872	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	KRE9	P39005	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	PEX31	P53203	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	SCS7	Q03529	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	DPP1	Q05521	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	PEX30	Q06169	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	PLP2	Q12017	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	PER33	Q12144	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	LAG2	Q92325	660 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	IFM1	P25038	676 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	NAM9	P27929	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	MRX3	P38172	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	OXA1	P39952	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YAT2	P40017	923 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	ASG7	P46993	209 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	NRM1	P53718	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	GIM3	P53900	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YJR012C	P47087	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YJR054W	P47114	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YGR015C	P53208	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	BNA7	Q04066	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YET2	Q04210	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	SNF8	Q12483	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	STE7	P06784	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	COQ1	P18900	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	PBN1	P25580	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	WSC4	P38739	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YGL260W	P53056	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	TPN1	P53099	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	TAF9	Q05027	157 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	SPO77	Q06134	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL228W	YNL228W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MER1	P16523	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MRPL25	P23369	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MRPL10	P36520	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	YBR241C	P38142	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MAL32	P38158	584 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	SHC1	P39000	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	TIM17	P39515	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	IBA57	P47158	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MAL12	P53341	584 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL228W	YNL228W	MIM1	Q08176	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 74 ms