RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeastyeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIN4YMR138W APD1P38281 316 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W AIM10P39965 576 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W IES5P40060 125 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W NAS2P40555 220 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W IRC5P43610 853 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YNR040WP53736 256 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YNL165WP53891 406 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W NUP116Q02630 1113 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W PLB2Q03674 706 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W BNA7Q04066 261 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W AGE1Q04412 482 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YLR173WQ06247 608 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YLR352WQ06479 807 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W HMS1Q12398 434 aa5.24□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W MET17P06106 444 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W PDE2P06776 526 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W MET2P08465 486 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W SPO7P18410 259 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W FPS1P23900 669 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W SOF1P33750 489 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YHR035WP38769 630 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W PTH1P38876 190 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W DDI1P40087 428 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W SFH5P47008 294 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W NIT2P47016 307 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W KAP120Q02932 1032 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W RCF1Q03713 159 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W NEJ1Q06148 342 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YDL114WQ07530 308 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W COX17Q12287 69 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W FRE6Q12473 712 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W LSO1Q3E827 93 aa5.23□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W QCR7P00128 127 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W RAS1P01119 309 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W SCEIP03882 235 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W RPL43BP0CX26 92 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W MRPS28P21771 286 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W PRE7P23724 241 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W ATG15P25641 520 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W PTC6P25646 442 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W RPL5P26321 297 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YKR015CP36111 568 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W SHE1P38200 338 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YBR096WP38256 230 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YHL037CP38733 133 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W MTC6P38849 526 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W SEN34P39707 275 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W PFS2P42841 465 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W CCC1P47818 322 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W NIT3P49954 291 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W SAM37P50110 327 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W BRR6P53062 197 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W NUP49Q02199 472 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W PET191Q02772 108 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W RSM28Q03430 361 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W GRX3Q03835 250 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W FIN1Q03898 291 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W COQ11Q05892 277 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YLR346CQ06139 101 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YDL180WQ12301 547 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W YOL114CQ12322 202 aa5.22□□□□□ -1.57
CIN4YMR138W HEM4P06174 275 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W COX9P07255 59 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W YGL041W-AP0C5N3 154 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W RPI1P23250 407 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W EXG1P23776 448 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.21□□□□□ -1.58not detected
CIN4YMR138W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W DTR1P38125 572 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W THI2P38141 450 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W FMP23P38231 175 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W PHO90P39535 881 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W PMT6P42934 759 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W SCY1P53009 804 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W AIM36Q03798 255 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W GAL83Q04739 417 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W FMP42Q04991 504 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W IPK1Q06667 281 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W RAF1Q06891 181 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W AIM6Q07716 390 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W YOR238WQ08634 303 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W ACF2Q12168 779 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W RBD2Q12270 262 aa5.21□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W PRB1P09232 635 aa5.2□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W NFT1P0CE68 1218 aa5.2□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W TAL1P15019 335 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W MAK32P23060 363 aa5.2□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W YME2P32843 850 aa5.2□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W YPK3P38070 525 aa5.2□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W NVJ1P38881 321 aa5.2□□□□□ -1.58
CIN4YMR138W PCL6P40038 420 aa5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.8 ms