RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SPT3P06844 337 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W BAR1P12630 587 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ART10P18634 518 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W HNM1P19807 563 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RPB8P20436 146 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SLM5P25345 492 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W URA7P28274 579 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RPN2P32565 945 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MSN2P33748 704 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W POP4P38336 279 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W HSM3P38348 480 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W TRR2P38816 342 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W AST2P39945 430 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ALG5P40350 334 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W REE1P40893 198 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W APS3P47064 194 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YNL234WP53857 426 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MEH1Q02205 184 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SPO19Q03029 223 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PIN3Q06449 215 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YPR172WQ06608 200 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YPR091CQ06833 770 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GRC3Q07845 632 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YPL247CQ12523 523 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YMR030W-AQ3E760 96 aa1.89□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MF(ALPHA)1P01149 165 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W STE7P06784 515 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YML002WP0CF17 737 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W TFS1P14306 219 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MCK1P21965 375 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W NUF2P33895 451 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ANS1P38832 159 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YER188WP40103 239 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W EFM4P40516 257 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YIL001WP40560 513 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YIR020CP40575 100 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data1.88□□□□□ -2.11not detected
SSQ1YLR369W YRB1P41920 201 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ATG27P46989 271 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CDH1P53197 566 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data1.88□□□□□ -2.11not detected
SSQ1YLR369W RPM2Q02773 1202 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W COS7Q07788 383 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W APC2Q12440 853 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SPE4Q12455 300 aa1.88□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W NOP1P15646 327 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W OLE1P21147 510 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MDH2P22133 377 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ITR2P30606 609 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MFT1P33441 392 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W BMT2P38278 337 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MTC4P38335 694 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YHR177WP38867 453 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YIL060WP40519 144 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YIL029CP40538 142 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PTR3P43606 678 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W NCA3P46955 337 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CRZ1P53968 678 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YMR102CQ03177 834 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W NHP10Q03435 203 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ADE13Q05911 482 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W NMD4Q12129 218 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MDY2Q12285 212 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PSF1Q12488 208 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GCN4P03069 281 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ARG81P05085 880 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GPH1P06738 902 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CBF1P17106 351 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W FAR1P21268 830 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MRPS28P21771 286 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YME2P32843 850 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W VPS51P36116 164 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W OLA1P38219 394 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ICS2P38284 255 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YBR220CP38318 560 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W TSC10P38342 320 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SEC28P40509 296 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RTS2P40962 232 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MIC19P43594 170 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W LSG1P53145 640 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PCP1P53259 346 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W DSL1P53847 754 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RHO4Q00246 291 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CIK1Q01649 594 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CSN9Q03981 162 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SML1Q04964 104 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ATG26Q06321 1198 aa1.87□□□□□ -2.11
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