RNA–Protein interactions for RNA: YJL209W

CBP1, Transcript of Mitochondrial protein, regulator of COB mRNA stability and translation, yeast

Gene CBP1, Length 1,965 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP1	YJL209W	YPC1	P38298	316 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	PCL6	P40038	420 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	GET1	P53192	235 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	POP6	P53218	158 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YGR067C	P53243	804 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	IRC10	Q08118	586 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	DSE3	Q08729	430 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SLM3	Q12093	417 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SLY1	P22213	666 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	KDX1	P36005	433 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YAT2	P40017	923 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	JLP2	P40206	208 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	ASG7	P46993	209 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YJR079W	P47126	109 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	UBC13	P52490	153 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	NIF3	P53081	288 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	ATP23	P53722	227 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	TFS1	P14306	219 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YBR241C	P38142	488 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	ECM8	P38246	354 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SUR2	P38992	349 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	MTM1	P53320	366 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	ECI1	Q05871	280 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	DDC1	Q08949	612 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	VIK1	Q12045	647 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SSO1	P32867	290 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	VPS51	P36116	164 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YIL169C	P40442	995 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	MAL13	P53338	473 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	ATG17	Q06410	417 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	PLB3	Q08108	686 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	MUM3	Q08750	479 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	GPM2	Q12008	311 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YAK1	P14680	807 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SNF6	P18888	332 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	CPR3	P25719	182 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	AST1	P35183	429 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	COX15	P40086	486 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SWC4	P53201	476 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	VHT1	P53241	593 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	TMS1	Q12116	473 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	EHD3	P28817	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
CBP1	YJL209W	QRI5	P32344	111 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	ELM1	P32801	640 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	IKI1	P38874	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	MGA1	P53050	456 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YGL082W	P53155	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YNL095C	P53932	642 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	RSC9	Q03124	581 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	CTR3	Q06686	241 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YEH2	Q07950	538 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	NAM9	P27929	486 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	MOH1	P38191	138 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	ATG12	P38316	186 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YIA6	P40556	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YFR057W	P43625	151 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YJR012C	P47087	207 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	HCH1	P53834	153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SFH1	Q06168	426 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	MFG1	Q07684	458 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	PNS1	Q12412	539 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SPO23	P33757	523 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	AVT5	P38176	459 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YBR096W	P38256	230 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	DFG10	P40526	253 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YGL159W	P53110	370 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	MRM2	P53123	320 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	CTF19	Q02732	369 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	TRM82	Q03774	444 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	MHR1	Q06630	226 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBP1	YJL209W	TAF10	Q12030	206 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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