RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	CHO1	P08456	276 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	ELO2	P25358	347 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	BNA4	P38169	460 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	ILM1	P47155	203 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YPL068C	Q02749	293 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	TDA1	Q03533	586 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	HRD3	Q05787	833 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	ASR1	Q06834	288 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	SOR2	Q07786	357 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	TRM13	Q12383	476 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	MRP10	O75012	95 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	OPI3	P05375	206 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	TRM2	P33753	639 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	MRX3	P38172	270 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	RBG1	P39729	369 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	COG3	P40094	801 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
SET1	YHR119W	UBC7	Q02159	165 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	TPP1	Q03796	238 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	CTR3	Q06686	241 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	ICT1	Q12385	394 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YOP1	Q12402	180 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	CTA1	P15202	515 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	ERD1	P16151	362 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	EPT1	P22140	391 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	MXR2	P25566	168 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	MBB1	P39534	108 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	EXO1	P39875	702 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	UFD1	P53044	361 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	ALG13	P53178	202 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	COG7	P53195	279 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	CPD1	P53314	239 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	CSN9	Q03981	162 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	BNA5	Q05979	453 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	MLH3	Q12083	715 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	TPO4	Q12256	659 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YER076C	P40049	302 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	NUP57	P48837	541 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	BOR1	P53838	576 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	RDI1	Q12434	202 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	PSF1	Q12488	208 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SET1	YHR119W	TY1B-H	O13535	1793 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SIR4	P11978	1358 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MBR1	P23493	339 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	HCM1	P25364	564 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ATO2	P32907	282 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	THI80	P35202	319 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	TVP38	P36164	337 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ARP1	P38696	384 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MET30	P39014	640 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YIA6	P40556	373 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YML096W	Q04489	525 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	NAT4	Q04751	285 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ENB1	Q08299	606 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MRX4	Q12467	430 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MET5	P47169	1442 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	COX1	P00401	534 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	TPK3	P05986	398 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	PHA2	P32452	334 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SPS18	P32572	300 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	GDA1	P32621	518 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SPC34	P36131	295 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	FRM2	P37261	193 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SDH8	P38345	138 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CTF8	P38877	133 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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